Objetivo
Many important cellular processes are controlled by networks of biochemical reactions. The individual components of the network and their interactions are often well known. However, the functioning of these networks remains an important issue for research. Recent research has shown that, due to the very low concentrations of molecules involved, biochemical networks are highly stochastic. Particle-based approaches are needed in order to model the large fluctuations that are involved. Spatial diffusion, localized clustering of molecules and spatial fluctuations are all-important issues that can only be approached by a spatially resolved modelling approach. Current particle-based methods do not resolve the positions of individual particles in space. The proposed project involves the development of a new computer simulation scheme for biochemical networks. This will be particle-based and spatially resolved and so Will naturally address the difficulties of the current methods. The new scheme will represent a considerable advance in computer simulation methodology, since twill allows simulation on timescales up to minutes. To do this, it will use existing analytical solutions of the Schmoluchowski equation for diffusing reactive pairs of particles.
These will be used for time propagation, allowing very large timesteps, limited only by the need for only one collision to occur per particle per timestep. The method will then be applied to several well-characterized examples of biochemical networks. Simple genetic networks, in which DNA is used to make proteins which in turn influence their own production from the DNA, will be modelled in collaboration with experimental workers. Bad erial chemotaxis, which ¡s a mechanism by which bacteria detect and respond to external signals, will also be modelled. The new method will be tested against previous experimental and theoretical results on these systems.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas biología celular
- ciencias naturales matemáticas matemáticas aplicadas modelo matemático
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
UTRECHT
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.