Objectif
In recent years, genomic searches performed in several laboratories have indicated the high prevalence of identified new small, untranslated RNAs in all organisms, from bacteria to animals and plants. In the enterobacterial model E. coli, many new RNAs were identified (50) or predicted (250). However, although their expression patterns suggest involvement in stress responses, few of them have at present a biological function assigned to it. Moreover, even for the few for which information about a biological role has been obtained, detailed mechanistic understanding has not been obtained. Different approaches can be used to address function. Since E. coli is a genetically tractable organism, small RNA knockout or overexpression strains can easily be constructed for subsequent phenotypic analyses. Functional genomics approaches such as phenotype arrays, 2D gels, and microarrays will help to identify the regulated target genes and/ or pathways affected by chosen small RNAs (monitoring changes in mRNAs, or proteins). In addition, a bioinformatics approach developed recently in the host group will be employed to search for target mRNA, on the assumption that most of the small RNAs may act as antisense RNAs. This will be followed up by measuring small RNA effects on target/ reporter gene fusion constructs. Furthermore, small RNA/ target control systems will be characterised in detail by mechanistic studies, primarily carried out in vitro (RNA structure determination, RNA-RNA interaction, effects of helper proteins etc.). In conclusion the proposed work is expected to highlight the variety of ways in which sRNAs can regulate gene expression and the physiological conditions under which they are believed to function, as well as their biochemical properties, and their mode of action. In addition, an elucidation of sRNA-mediated control in bacteria may be of great relevance for comparisons to small RNA (e.g. microRNA) dependent regulation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- ingénierie et technologie génie électrique, génie électronique, génie de l’information ingénierie électronique système d’automatisation et de contrôle
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
UPPSALA
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.