Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-05-29

A quest for biological roles of new small RNAs in Escherichia coli

Cel

In recent years, genomic searches performed in several laboratories have indicated the high prevalence of identified new small, untranslated RNAs in all organisms, from bacteria to animals and plants. In the enterobacterial model E. coli, many new RNAs were identified (50) or predicted (250). However, although their expression patterns suggest involvement in stress responses, few of them have at present a biological function assigned to it. Moreover, even for the few for which information about a biological role has been obtained, detailed mechanistic understanding has not been obtained. Different approaches can be used to address function. Since E. coli is a genetically tractable organism, small RNA knockout or overexpression strains can easily be constructed for subsequent phenotypic analyses. Functional genomics approaches such as phenotype arrays, 2D gels, and microarrays will help to identify the regulated target genes and/ or pathways affected by chosen small RNAs (monitoring changes in mRNAs, or proteins). In addition, a bioinformatics approach developed recently in the host group will be employed to search for target mRNA, on the assumption that most of the small RNAs may act as antisense RNAs. This will be followed up by measuring small RNA effects on target/ reporter gene fusion constructs. Furthermore, small RNA/ target control systems will be characterised in detail by mechanistic studies, primarily carried out in vitro (RNA structure determination, RNA-RNA interaction, effects of helper proteins etc.). In conclusion the proposed work is expected to highlight the variety of ways in which sRNAs can regulate gene expression and the physiological conditions under which they are believed to function, as well as their biochemical properties, and their mode of action. In addition, an elucidation of sRNA-mediated control in bacteria may be of great relevance for comparisons to small RNA (e.g. microRNA) dependent regulation.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

FP6-2002-MOBILITY-5
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordynator

UPPSALA UNIVERSITY
Wkład UE
Brak danych
Adres
Sankt Olofsgatan 10B
UPPSALA
Szwecja

Zobacz na mapie

Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0