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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Contenuto archiviato il 2024-06-20

In-Silico Prediction of gene function

Obiettivo

The GENEFUN project aims at addressing two important issues. Improving existing sequence-similarity based function annotation tools, and developing and integrating methods that consider information on 3D structure as well as on physical and functional interactions between genes and proteins and the processes in which they are involved. 1- It will develop criteria for evaluating the reliability of the annotations currently available in databases. These criteria will be used to assign reliability scores to these annotations and will be incorporated into standard annotation pipelines, for future use. 2- Higher-level features will be incorporated into functional annotations by combining sequence and structure information in order to identify non-linear functional features (interaction sites) and by integrating different methods for inferring function from context-based information (domain architecture, protein-protein interaction, gene order etc.). To achieve these goals several European groups with a strong track record in various aspects of bioinformatics have teamed up with an experimental group from Canada, which is well known for its strength in structural and functional proteomics. The expected output of the project is: improved procedures for inferring function on the basis of sequence similarity, a set of procedures for predicting non-linear functional features from sequence and 3D structure, and benchmarked procedures for predicting context-based functional features. Major efforts will be devoted to protocols that optimally combine the results from several methods. These protocols will be made available to the scientific community via the Web, and the community will be introduced to them through open workshops and training sessions.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2002-LIFESCIHEALTH
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinatore

UNIVERSITÉ LIBRE DE BRUXELLES
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (10)

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