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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-29

Models of biological macromolecules

Objetivo

The project deals with the development, analysis and application of coarse-grained models for the study of macromolecules of biological importance. The size and operational time scale of these molecules often prevent a direct application of more detailed calculations and descriptions, and requires the development of computationally efficient, yet physically sound, coarse grained models. Since biological macromolecules operate in an aqueous environment characterized by a huge thermal noise, these models are stochastic in nature and constitute a challenge for the field of non-equilibrium statistical physics.

The project is divided into three research objectives. In the research objective 1, I propose a rigorous study of the kinetics of motor proteins with the help of methods of statistical physics. The generalization of these theories is important for a number of problems of biological relevance, as polymer translocation and DNA/RNA packing in viruses. The characterization of equilibrium properties of polymers of arbitrary stiffness in confined geometries constitutes the main focus of the research objective 2. Analytical methods and Monte Carlo computer simulations are used to calculate probability distribution functions and entropic forces with a number of different boundary conditions. Applications are foreseen in biophysical studies of F-actin, DNA, microtubules and other protein filaments.

The research objective 3 aims at the conceivement and application of computationally efficient coarse-grained models for the investigation of protein structures of considerable size. A considerable part of the project is dedicated to the introduction of the electrostatic interaction in Go models, an essential step to address the study of the function of proteins, given their structure. The validity of the proposed models will be assessed through a comparison with more detailed calculations for a number of target biomolecules of small size.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2002-MOBILITY-11
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERG - Marie Curie actions-European Re-integration Grants

Coordinador

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI BARI
Aportación de la UE
Sin datos
Dirección
Piazza Umberto I, n. 1
BARI
Italia

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Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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