Objectif
The project deals with the development, analysis and application of coarse-grained models for the study of macromolecules of biological importance. The size and operational time scale of these molecules often prevent a direct application of more detailed calculations and descriptions, and requires the development of computationally efficient, yet physically sound, coarse grained models. Since biological macromolecules operate in an aqueous environment characterized by a huge thermal noise, these models are stochastic in nature and constitute a challenge for the field of non-equilibrium statistical physics.
The project is divided into three research objectives. In the research objective 1, I propose a rigorous study of the kinetics of motor proteins with the help of methods of statistical physics. The generalization of these theories is important for a number of problems of biological relevance, as polymer translocation and DNA/RNA packing in viruses. The characterization of equilibrium properties of polymers of arbitrary stiffness in confined geometries constitutes the main focus of the research objective 2. Analytical methods and Monte Carlo computer simulations are used to calculate probability distribution functions and entropic forces with a number of different boundary conditions. Applications are foreseen in biophysical studies of F-actin, DNA, microtubules and other protein filaments.
The research objective 3 aims at the conceivement and application of computationally efficient coarse-grained models for the investigation of protein structures of considerable size. A considerable part of the project is dedicated to the introduction of the electrostatic interaction in Go models, an essential step to address the study of the function of proteins, given their structure. The validity of the proposed models will be assessed through a comparison with more detailed calculations for a number of target biomolecules of small size.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
- sciences naturelles sciences physiques mécanique classique mécanique statistique
- sciences naturelles mathématiques mathématiques appliquées modèle mathématique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2002-MOBILITY-11
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
BARI
Italie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.