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Contenuto archiviato il 2024-06-25

Systems biology of the AMP-activated protein kinase pathway

Obiettivo

Biology is moving from describing phenomena to understanding design principles and dynamic operation of cellular modules, entire cells, and even organisms. The quantitative approach to biological systems is driven by technological advances and close collaboration between different disciplines. Understanding properties of biological systems holds significant promises for drug development, treatment of diseases or improving bioprocesses. In this project, experimental and theoretical studies will be integrated to achieve a better understanding of the dynamic operation of the AMP-activated protein kinase (AMPK) signalling pathway. This pathway plays a central role in monitoring the cellular energy status and trolling energy production and sumption. The ceptional project idea is to generate kinetic mathematical descriptions of pathway activation/deactivation in yeast and mammalian cells. The approach will be highly systematic. A first network model will be generated based on existing data. A standard dataset, including diverse data such as relative and absolute protein, mRNA and metabolite levels and capturing the dynamics of the pathway, will be used to establish kinetic models of yeast and mammalian AMPK. These models will be improved and optimised iteratively in several rounds. A major challenge will be the attempt to use information from the yeast model to fill gaps in the model describing mammalian AMPK. The computational models will support drug development at an SME that is fully integrated into all project activities, If successful, the results will have major payoff to tackle some of the most rapidly advancing diseases in the modern world, obesity and type-2 diabetes. Hence, the project will result in a case study for employing systems biology in drug target identification and in drug development and it will produce results exploitable also for engineering of microbial metabolism and systems biology software development.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2004-LIFESCIHEALTH-5
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

STIP - Specific Targeted Innovation Project

Coordinatore

GÖTEBORGS UNIVERSITET
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (5)

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