ENFIN - an experimental network for functional integration

Información del proyecto

ENFIN

Identificador del acuerdo de subvención: 518254

Proyecto cerrado

Fecha de inicio 15 Noviembre 2005

Fecha de finalización 14 Mayo 2011

Financiado con arreglo a

• Life sciences, genomics and biotechnology for health: Thematic Priority 1 under the Focusing and Integrating Community Research programme 2002-2006.

Coste total

€ 8 967 500,00

Aportación de la UE

€ 8 967 500,00

Coordinado por

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

Objetivo

We propose to form a Network of Excellence in the area of bioinformatics to provide a Europe-wide integration of computational approaches in systems biology. This network will be focused on the development and critical assessment of computational approaches in this area, but uniquely will bring together a range of backgrounds and laboratory contexts that will span investigative computer science through to traditional wet-bench molecular biology. Despite the progress in bioinformatics methods and databases, even the best experimental labs use. only a small number of computational tools in their work and rarely exploit the potential of multiple datasets. This network will enable a transformation of the way computational analysis is used in the laboratory and the infrastructure will be entirely open, analogous to the genome information. To achieve its goals, the network will internally have close collaboration between experimental and computational research, with a specific consumables budget for experimentally testing predictions. The computational work includes the development of a distributed database infrastructure appropriate for small laboratories and development of analysis methods including Bayesian networks, metabolite flux modeling and correlations of protein modifications to pathways. The experimental techniques used to test this system include mass spectroscopy, synthetic peptide biochemistry and RNAi knockdown. Where appropriate we have chosen experimental areas connected to intracellular signaling associated with the cell cycle. An additional benefit will be greater understanding in this area. Overall the ENFIN network will deliver four main products: a platform for database provision of diverse biological data (the ENFIN core), a suite of analysis tools integrated with this platform (the ENFIN analysis layer), extensive documentation written from the wet laboratory perspective and "best practice" guidelines...

Ámbito científico (EuroSciVoc)

• ciencias naturales › ciencias biológicas › bioquímica › biomoléculas › proteínas › proteómica
• ciencias naturales › informática y ciencias de la información › base de datos
• ciencias naturales › ciencias biológicas › genética › genoma
• ciencias naturales › ciencias físicas › óptica › espectroscopia
• ciencias naturales › ciencias biológicas › biología molecular

Programa(s)

• FP6-LIFESCIHEALTH - Life sciences, genomics and biotechnology for health: Thematic Priority 1 under the Focusing and Integrating Community Research programme 2002-2006.

Tema(s)

• LSH-2004-1.1.4-1 - Development of a European-wide package for creating and integrating relevant databases and analysis software to enable systems-level interpretation of complex experimental data in functional genomics

Convocatoria de propuestas

FP6-2004-LIFESCIHEALTH-5
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Régimen de financiación

NoE - Network of Excellence

Coordinador

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Meyerhostrasse 1 ; HEIDELBERG ; Alemania
• Coste total: Sin datos

Participantes (22)

UNIVERSITY OF DUNDEE

Reino Unido

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Nethergate ; DUNDEE
• Coste total: Sin datos

TECHNICAL UNIVERSITY OF DENMARK

Dinamarca

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Anker Engelundsvej 1 ; KGS. LYNGBY
• Coste total: Sin datos

UNIVERSITY OF ROME TOR VERGATA

Italia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Via Carnevale ; ROME
• Coste total: Sin datos

MEDICAL RESEARCH COUNCIL

Reino Unido

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: 20 Park Crescent ; n/a LONDON
• Coste total: Sin datos

LUDWIG INSTITUTE FOR CANCER RESEARCH

Suecia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: 595 UPPSALA
• Coste total: Sin datos

HELSINGIN YLIOPISTO

Finlandia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Yliopistonkatu 4 ; HELSINGIN YLIOPISTO, HELSINKI
• Coste total: Sin datos

UNIVERSITY COLLEGE LONDON

Reino Unido

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Gower Street ; LONDON
• Coste total: Sin datos

CENTER FOR RESEARCH AND TECHNOLOGY, HELLAS

Grecia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: 6th Km Charilaou-Thermi Road ; 361 THERMI - THESSALONIKI
• Coste total: Sin datos

UNIVERSITAET ZU KOELN

Alemania

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Albertus-Magnus-Platz 3 ; KOELN
• Coste total: Sin datos

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE

Israel

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Herzl St. ; REHOVOT
• Coste total: Sin datos

AS EGEEN

Estonia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Ã?likooli 6a ; TARTU
• Coste total: Sin datos

SERONO PHARMACEUTICAL RESEARCH INSTITUTE (SPRI), A DIVISION OF SERONO INTL. S.A. (SERONO INTERNATIONAL SA)

Suiza

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: 14, Chemin des Aulx ; PLAN-LES-OUATES
• Coste total: Sin datos

CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS

España

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: C/Serrano. 117 ; MADRID
• Coste total: Sin datos

FUNDACION CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES ONCOLÃ?GICAS CARLOS III

España

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: C/ Melchor Fernanndez Almagro, 3 ; MADRID
• Coste total: Sin datos

TECHNISCHE UNIVERSITAET CAROLO-WILHELMINA ZU BRAUNSCHWEIG

Alemania

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Pockelsstrasse 14 ; BRAUNSCHWEIG
• Coste total: Sin datos

OÜ QURETEC

Estonia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Ülikooli 6a ; TARTU
• Coste total: Sin datos

COMMISSARIAT A L'ENERGIE ATOMIQUE

Francia

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Batiment le Ponant D - 25, rue leblanc ; PARIS
• Coste total: Sin datos

SWISS INSTITUTE OF BIOINFORMATICS

Suiza

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: CMU 1 Rue Michel Servet ; GENEVA
• Coste total: Sin datos

LUDWIG INSTITUTE FOR CANCER RESEARCH LTD.

Suiza

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Postfach ; ZUERICH
• Coste total: Sin datos

HUMBOLDT-UNIVERSITAET ZU BERLIN

Alemania

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Unter den Linden 6 ; BERLIN
• Coste total: Sin datos

UNIVERSITAET BASEL

Suiza

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Petersplatz 1 ; BASEL
• Coste total: Sin datos

MAX PLANCK GESELLSCHAFT ZUR FOERDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV., REPRESENTED BY MAX PLANCK INSTITUTE OF BIOCHEMISTRY

Alemania

• Aportación de la UE: Sin datos
• Dirección: Am Klopferspitz 18 ; MARTINSRIED
• Coste total: Sin datos