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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-27

Sequence similarity networks: a promising complement to the phylogenetic framework to study evolutionary biology

Objectif

The comparison of molecular sequences from organisms, environmental samples and mobile genetic elements is fundamental in evolutionary biology to study genes, genomes and species evolution. Although phylogenetic methods play a major role in these analyses, through the inference of phylogenetic trees or networks based on families of homologous sequences, many data remained underexplored as the number of molecular sequences of interest exponentially grows, with typical environmental samples containing thousands of species represented by millions of sequences. In order to further enhance the evolutionary comparison of molecular sequences, this project will develop a complementary approach, the use of large complex similarity networks (typically a few million nodes and tens of millions of edges), adapted to evolutionary biology questions. Such networks, inspired by the studies on social and regulatory networks, are only currently studied by a limited number of research teams. They allow for fast inclusive comparative analyses of both (highly) divergent and conserved sequences, fully or partly similar. This project will consist in developing similarity networks to (i) identify and study chimeric genes and genomes, (ii) detect and analyze the common genetic goods shared between gene families and within microbial communities, (iii) test whether genetic diversity in environmental sequences is significantly larger, both quantitatively and qualitatively, than genetic diversity in the gene families of cultured organisms (and their MGE), (iv) improve the statistical framework to compare similarity networks. If funded, this project will provide an additional comparative framework, new methods of detection of environmental/genomic sequences of medical and biological interest, and a novel description of the structure of genetic diversity on Earth, unraveling the main partnerships and barriers to the exchange of sequences of DNA between genes, genomes, species and environments.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

ERC-2013-CoG
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-CG - ERC Consolidator Grants

Institution d’accueil

SORBONNE UNIVERSITE
Contribution de l’UE
€ 1 284 240,00
Adresse
21 RUE DE L'ECOLE DE MEDECINE
75006 PARIS
France

Voir sur la carte

Région
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (2)

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