Objectif
Secondary membrane transporters are found across the biological kingdom. The structural dynamics of their actions are elusive, as our understanding relies on few X-ray structures. Comparisons of the available structures show that large re-arrangements take place between two domains during transport, with what is generally described as a “rocking-bundle model”. However, dynamic motion between the transport domains remains largely inaccessible to most experimental analysis methods. Here we propose to use a novel mass spectrometric approach that allows the desolvation of intact membrane proteins directly from detergent or lipid environments in combination with ion mobility mass spectrometry to monitor conformational changes in secondary transporters. This study will initially focus on the glutamate transporter GltPh for which structures, inhibitor, mutagenesis and cysteine cross-linking studies are available. We will then apply the same approach to the less-well understood transporters harboring the NhaA-fold. The goal will be to elucidate the conformational dynamics of NhaA, NapA, and ASBT proteins during transport and monitor the effects of substrates, ions, lipids and oligomerization. In summary, this project aims to establish a novel mass spectrometry-based methodology to bridge the gap between structure and function of secondary active transporters.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule lipides
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.