Objectif
There is an urgent need to improve approaches for cancer diagnosis and targeted treatment, which requires a detailed understanding of the disease and its genetic basis. The advent of next-generation sequencing has allowed researchers to obtain comprehensive profiles of acquired genetic mutations in patient tumors. However, due to primarily reasons of cost, these sequencing approaches have so far ignored mutations in the multitude of non-protein-coding DNA sequence elements that control and regulate gene expression, and strong evidence is currently accumulating that mutations in these regions can cause cancer.
With recent improvements in DNA sequencing efficiency and cost, it is now becoming feasible for large research consortia such as The Cancer Genome Atlas (TCGA) to perform whole genome sequencing (WGS) in large cohorts of cancer patients. The proposed research project, “CancerGenomes”, aims to systematically detect and functionally characterize cancer mutations in non-protein-coding regulatory regions using WGS datasets from TCGA. Specifically, I will develop computational and statistical methodology for detecting and evaluating the functional impact of non-coding mutations. Using WGS data from more than 700 cancer genomes in >20 cancer types, I will derive a pan-cancer atlas of candidate functional non-coding mutations and analyze their impact on individual cancer genes, pathways and regulatory networks.
The feasibility of the project will be guaranteed by the applicant’s strong background in cancer genomics and TCGA data analysis in synergy with the host group’s unique expertise in gene regulation and whole genome sequencing analysis. Ultimately, the discovery of new cancer driver mutations in non-coding regions can lead to new anti-cancer drug targets and more accurate diagnosis of cancer patients.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IIF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.