Objectif
Biocatalysis is based on the application of natural catalysts for new purposes, for which the enzymes were not designed. Although the first examples of biocatalysis were reported more than a century ago, biocatalysis was revolutionized after the discovery of an in vitro version of Darwinian evolution called Directed Evolution (DE). Despite the recent advances in the field, major challenges remain to be addressed. Up to date, the best experimental approach consists of creating multiple mutations simultaneously but limit the choices using statistical methods. Still, tens of thousands of variants need to be tested experimentally. In addition to that, little information is available as to how these mutations lead to enhanced enzyme proficiency. Significant advances in computational tools have enabled the de novo design of enzymes catalyzing unnatural reactions making use of the so-called inside-out computational protocol developed by the groups of Prof. Baker and Prof. Houk. Despite the initial computational successes, the most active computationally designed enzymes still perform quite poorly in comparison with the natural and DE-engineered enzymes. This project aims to computationally unveil the molecular basis of improved catalysis achieved by Directed Evolution. In particular, quantum mechanics, Molecular Dynamics simulations, and QM/MM strategies will be used to study some selected DE-engineered enzymes. The strengths and weaknesses of the current version of the computational protocol will be explored, and a more efficient approach will be proposed. The development of more robust computational methods to predict amino-acid changes needed for activity is of the utmost importance as the need for experimentally probing randomized sequences would be greatly reduced, rendering the route to novel biocatalysts much more efficient. This might represent a cheap and environmentally friendly alternative for industries to produce active catalysts for any desired target.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques physique quantique
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse biocatalyse
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
17004 Girona
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.