Description du projet
Des biocapteurs cellulaires pour un diagnostic avancé
Les technologies actuelles de diagnostic en présence de plusieurs biomarqueurs sont complexes et coûteuses, mais les cellules vivantes offrent une solution évolutive et abordable. Financé par le Conseil européen de la recherche, le projet COMPUCELL propose de concevoir des récepteurs chimériques dans la bactérie Bacillus subtilis afin de détecter les biomarqueurs, à l’aide de techniques de détection des anticorps. Son principal objectif consiste à faire progresser la biologie synthétique et explorer les ordinateurs biologiques capables d’effectuer des analyses de biomarqueurs multiplexés. COMPUCELL fournira un prototype destiné au diagnostic de la néphropathie diabétique dans l’urine, mais la plateforme de détection réutilisable pourrait trouver des applications dans d’autres domaines, notamment la surveillance de l’environnement.
Objectif
Early diagnostics based on multiple biomarkers is key in numerous diseases, yet current technologies for multiplexed detection are complicated and expensive. Living cells detect and process various environmental signals in parallel and can self-replicate, presenting an attractive platform for scalable and affordable autonomous diagnostic devices. In this project, I will apply my expertise in synthetic biology, the rational engineering of biological systems, to build cell-based biosensors for multiplexed diagnosis using the non-pathogenic bacterium Bacillus subtilis.
In a first research line, I will conceive a scalable detection machinery by engineering chimeric receptors detecting extracellular biomarkers via sensing domains derived from antibodies. In a second research line, I will implement bio-molecular computing systems operating within and across bacterial cells to perform multiplexed biomarkers analysis. I will deploy in B. subtilis biomolecular logic gates and will engineer specific cell-cell communication systems to perform distributed multicellular computation in a bacterial consortia.
My project is highly interdisciplinary and is at the cross-roads of genetic engineering, structural biology, biophysics, modeling, and clinics. On foundational point of view, I will make several breakthrough contributions to synthetic biology: (i) Advancing engineering frameworks for the Gram-positive model, B. subtilis. (ii) Pushing the limits of custom-ligand detection by engineered cells (iii) Exploring the frontiers of man-made biological computers. On an applied point of view, I plan to deliver a first prototype for the urinary diagnostic of diabetic nephropathy, a major complication of diabetes. Because of the modular design principles applied, my sensing platform will be reusable to diagnose other pathologies as well as for applications requiring custom-detection and bio-molecular computation like targeted therapy, drug delivery, or environmental monitoring.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule acide nucléique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biologie synthétique
- sciences naturelles sciences biologiques biophysique
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire biologie structurale
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2014-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75654 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.