Small RNA regulation of the body plan and epigenome in Arabidopsis embryos

Información del proyecto

sRNA-EMB

Identificador del acuerdo de subvención: 637888

DOI

10.3030/637888

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 20 Junio 2015

Fecha de inicio 1 Julio 2015

Fecha de finalización 30 Junio 2020

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 499 988,99

Aportación de la UE

€ 1 499 988,99

Coordinado por

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZENBIOLOGIE GMBH
Austria

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Publicaciones

Peer reviewed articles (6)

Novel small RNA spike-in oligonucleotides enable absolute normalization of small RNA-Seq data

Autores: Stefan Lutzmayer, Balaji Enugutti, Michael D. Nodine
Publicado en: Scientific Reports, Edición 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-06174-3

Widespread Contamination of Arabidopsis Embryo and Endosperm Transcriptome Data Sets

Autores: Michael A. Schon, Michael D. Nodine
Publicado en: The Plant Cell, Edición 29/4, 2017, Página(s) 608-617, ISSN 1040-4651
Editor: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.16.00845

MicroRNA Dynamics and Functions During Arabidopsis Embryogenesis

Autores: Alexandra Plotnikova, Max J. Kellner, Michael A. Schon, Magdalena Mosiolek, Michael D. Nodine
Publicado en: The Plant Cell, Edición 31/12, 2019, Página(s) 2929-2946, ISSN 1040-4651
Editor: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.19.00395

NanoPARE: parallel analysis of RNA 5′ ends from low-input RNA

Autores: Michael A. Schon, Max J. Kellner, Alexandra Plotnikova, Falko Hofmann, Michael D. Nodine
Publicado en: Genome Research, Edición 28/12, 2018, Página(s) 1931-1942, ISSN 1088-9051
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.239202.118

The embryonic transcriptome of Arabidopsis thaliana

Autores: Falko Hofmann, Michael A. Schon, Michael D. Nodine
Publicado en: Plant Reproduction, Edición 32/1, 2019, Página(s) 77-91, ISSN 2194-7953
Editor: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00497-018-00357-2

Chromatin regulates expression of small RNAs to help maintain transposon methylome homeostasis in Arabidopsis

Autores: Ranjith K. Papareddy, Katalin Páldi, Subramanian Paulraj, Ping Kao, Stefan Lutzmayer, Michael D. Nodine
Publicado en: Genome Biology, Edición 21, 2020, Página(s) 1-24, ISSN 1474-760X
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-020-02163-4

Book chapters (1)

Small RNA In Situ Hybridizations on Sections of Arabidopsis Embryos

Autores: Katalin Páldi, Magdalena Mosiolek, Michael D. Nodine
Publicado en: Plant Embryogenesis - Methods and Protocols, Edición 2122, 2020, Página(s) 87-99, ISBN 978-1-0716-0341-3
Editor: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-0342-0_7