Small RNA regulation of the body plan and epigenome in Arabidopsis embryos

Informations projet

sRNA-EMB

N° de convention de subvention: 637888

DOI

10.3030/637888

Projet clôturé

Date de signature de la CE 20 Juin 2015

Date de début 1 Juillet 2015

Date de fin 30 Juin 2020

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 499 988,99

Contribution de l’UE

€ 1 499 988,99

Coordonné par

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZENBIOLOGIE GMBH
Austria

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (6)

Novel small RNA spike-in oligonucleotides enable absolute normalization of small RNA-Seq data

Auteurs: Stefan Lutzmayer, Balaji Enugutti, Michael D. Nodine
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-06174-3

Widespread Contamination of Arabidopsis Embryo and Endosperm Transcriptome Data Sets

Auteurs: Michael A. Schon, Michael D. Nodine
Publié dans: The Plant Cell, Numéro 29/4, 2017, Page(s) 608-617, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.16.00845

MicroRNA Dynamics and Functions During Arabidopsis Embryogenesis

Auteurs: Alexandra Plotnikova, Max J. Kellner, Michael A. Schon, Magdalena Mosiolek, Michael D. Nodine
Publié dans: The Plant Cell, Numéro 31/12, 2019, Page(s) 2929-2946, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.19.00395

NanoPARE: parallel analysis of RNA 5′ ends from low-input RNA

Auteurs: Michael A. Schon, Max J. Kellner, Alexandra Plotnikova, Falko Hofmann, Michael D. Nodine
Publié dans: Genome Research, Numéro 28/12, 2018, Page(s) 1931-1942, ISSN 1088-9051
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.239202.118

The embryonic transcriptome of Arabidopsis thaliana

Auteurs: Falko Hofmann, Michael A. Schon, Michael D. Nodine
Publié dans: Plant Reproduction, Numéro 32/1, 2019, Page(s) 77-91, ISSN 2194-7953
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00497-018-00357-2

Chromatin regulates expression of small RNAs to help maintain transposon methylome homeostasis in Arabidopsis

Auteurs: Ranjith K. Papareddy, Katalin Páldi, Subramanian Paulraj, Ping Kao, Stefan Lutzmayer, Michael D. Nodine
Publié dans: Genome Biology, Numéro 21, 2020, Page(s) 1-24, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-020-02163-4

Book chapters (1)

Small RNA In Situ Hybridizations on Sections of Arabidopsis Embryos

Auteurs: Katalin Páldi, Magdalena Mosiolek, Michael D. Nodine
Publié dans: Plant Embryogenesis - Methods and Protocols, Numéro 2122, 2020, Page(s) 87-99, ISBN 978-1-0716-0341-3
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-0342-0_7