Objectif
Fidelity during information transfer is essential for life, but it pays to be unfaithful if it provides an evolutionary advantage. The immune system continuously generates diversity to put up with recurrent pathogen challenges, and many viruses, in its turn, have evolved mechanisms to generate diversity to evade immune restrictions, even at the cost of enduring high mutation rates.
Synonymous codons are not used at random and are not translated with similar efficiency. A large proportion of viruses infecting humans, especially those causing chronic infections, display a poor adaptation to the codon usage preferences of their host. This observation is a paradox, as viral genes completely depend upon the cellular translation machinery for protein synthesis. The poor match between codon usage preferences of virus and host negatively affects speed and accuracy of viral protein translation. We propose here that maladaptation of codon usage preferences in human viruses may have an adaptive value as it decreases translational fidelity, results in the synthesis of an ill-defined population of viral proteins and provides a way to escape immune surveillance.
We will address the fitness effects of codon usage bias at the molecular and cellular levels, and later at the organism level in a rabbit model of papillomavirus infection. We will apply experimental evolution to analyse genotypic changes by means of next generation sequencing and will monitor phenotypic changes through real-time cell monitoring techniques, comparative proteomics, and anatomopathological analysis of virus-induced lesions.
Our results will help solve the evolutionary puzzle of codon usage bias, and will have implications for the development of therapeutic vaccines to guide the immune response towards the identification and targeting of the main protein species, avoiding the chemical noise generated by protein mistranslation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
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- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ADN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2014-CoG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.