Objectif
This proposal is centred on the development of small molecule probes derived from DNA damaging agents to identify their genomic targets using a novel unbiased approach. Although, several genotoxic drugs have been used for decades to treat cancers, the exact mechanisms by which they operate are not fully understood. It is established that these compounds interfere with the processes of transcription and replication, thereby promoting genomic instability and cell death. However, there is as yet no genome-wide map of the exact location of sites that are putative targets for these drugs in vivo. This information is critical to understand and rationalize cellular responses to genotoxic agents. Here, we propose to develop an innovative discovery- based methodology that will combine click chemistry in situ, affinity pull-down techniques and high throughput DNA sequencing (Drug-Seq), to identify the genomic interactome of DNA damaging drugs in order to elucidate their cellular activity at the molecular level. Two independent lines of enquiry will be followed. Firstly, we will establish the genomic interacting landscape of landmark drugs including etoposide, camptothecin and cisplatin using Drug-Seq. Secondly, we will perform regular chromatin immuno- precipitation sequencing (ChIP-Seq) of selected proteins linked to the cellular response of interest to validate Drug-Seq and further identify druggable genomic sites. An important aim of this proposal is to establish a universal methodology to decipher small molecule/genome interactions in vivo that trigger a particular response in disease-relevant models. We also seek to interrogate the role of chromatin in regulating drug/genome interactions and to define whether it is possible to act on the epigenome to modulate the activity and specificity of these drugs. Collectively, we anticipate our study will lay down the foundation for personalized medicine with the implementation of rational rather than empirical clinical protocols.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé médecine personnalisée
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2014-CoG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75231 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.