Objetivo
Small molecules can be used to probe for biological function of individual proteins. Achieving high selectivity with small molecules against structurally similar paralogues is a challenging task that makes it difficult to characterize function of individual member in the same protein family or individual domain in protein containing multiple target domains. The Bromo and Extra-Terminal (BET) proteins play important roles in transcriptional regulation by controlling networks of genes involved in cellular proliferation and cell cycle regulation. Key to the functions of BET proteins is a pair of highly homologous bromodomains (BD) in tandem, which bind and recognize histone acetylation on its tail. Elucidation of the process controlled by BET proteins would benefit greatly from chemical probes that perturb individual BD with high selectivity. Development of small molecules, including clinical candidate drug I-BET, builds a foundation for us to utilize this chemical probe approach, however lack of selectivity of I-BET against individual BD renders it inapplicable to serve as a chemical probe for individual protein or domain. Recently, we had demonstrated the feasibility of a “bump-and-hole” approach to engineer BD of BET proteins and I-BET molecule to achieve high selectivity. Here we propose to enhance the selectivity of BD and I-BET derivative pair to apply this technology and to probe for the function of individual BD in a cell-based model. Interaction between modified I-BET and selected BD variant, which retain its histone binding functionality, will be further optimized to achieve >100 fold selectivity against all wildtype BD. After that, a cell-based model will be built to substitute endogenous BET protein with exogenous BET containing BD variant. The ultimate goal is to develop a general chemical biology tool to elucidate the role of any individual BD-containing proteins by targeting specifically the engineered BD without affecting any other BD.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2014
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
DD1 4HN Dundee
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.