Objectif
Small molecules can be used to probe for biological function of individual proteins. Achieving high selectivity with small molecules against structurally similar paralogues is a challenging task that makes it difficult to characterize function of individual member in the same protein family or individual domain in protein containing multiple target domains. The Bromo and Extra-Terminal (BET) proteins play important roles in transcriptional regulation by controlling networks of genes involved in cellular proliferation and cell cycle regulation. Key to the functions of BET proteins is a pair of highly homologous bromodomains (BD) in tandem, which bind and recognize histone acetylation on its tail. Elucidation of the process controlled by BET proteins would benefit greatly from chemical probes that perturb individual BD with high selectivity. Development of small molecules, including clinical candidate drug I-BET, builds a foundation for us to utilize this chemical probe approach, however lack of selectivity of I-BET against individual BD renders it inapplicable to serve as a chemical probe for individual protein or domain. Recently, we had demonstrated the feasibility of a “bump-and-hole” approach to engineer BD of BET proteins and I-BET molecule to achieve high selectivity. Here we propose to enhance the selectivity of BD and I-BET derivative pair to apply this technology and to probe for the function of individual BD in a cell-based model. Interaction between modified I-BET and selected BD variant, which retain its histone binding functionality, will be further optimized to achieve >100 fold selectivity against all wildtype BD. After that, a cell-based model will be built to substitute endogenous BET protein with exogenous BET containing BD variant. The ultimate goal is to develop a general chemical biology tool to elucidate the role of any individual BD-containing proteins by targeting specifically the engineered BD without affecting any other BD.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie découverte de médicaments
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux cristaux
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale chimie médicinale
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2014
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
DD1 4HN Dundee
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.