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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Genome-wide analysis of RNA and protein interacting profiles during a plant virus infection

Obiettivo

Plant (+)strand RNA viruses account for important losses in crop yields worldwide. They complete complex infectious cycles by replicating, moving and inactivating plant defense mechanisms through multiple interactions of their RNA or proteins with host factors. Plants have evolved two main antiviral immunity systems operated by ARGONAUTE (AGO) proteins that target viral RNAs in the RNA silencing pathway or by resistance proteins that recognize viral-encoded proteins through protein-protein interactions. However, neither the identification of AGO target sites in viral RNAs nor the elucidation of the entire repertoire of proteins interacting with viral proteins has been reported for any plant virus. Now, the recent development of new technologies (and associated tools) such as high-throughput DNA sequencing and high performance mass spectrometry (MS) platforms makes possible to address these questions at a genome-wide level. InterAcTEV will combine these new technologies to study the recently described Arabidopsis/Tobacco etch virus (TEV)-TAMPS pathosystem with a multidisciplinary approach aimed to identify AGO target sites in TEV RNAs and to generate the first complete protein-protein interactome map for a plant virus. First, RNA-immunoprecipitation coupled with high-throughput sequencing methods will be optimized to identify AGO target sites in TEV RNAs at a genome-wide level. Second, we will combine novel high-affinity purification methods with MS analyses to identify the specific pool of Arabidopsis proteins interacting with each TEV protein. InterAcTEV will generate key knowledge to open new avenues for the understanding of resistance mechanisms in plants and to develop novel antiviral strategies for crop protection and securement of world’s food supply. Finally, the funding of InterAcTEV will allow the Experienced Researcher to initiate his own research project in the host laboratory and facilitate his transition to an independent research position in Europe.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 170 121,60
Indirizzo
CALLE SERRANO 117
28006 MADRID
Spagna

Mostra sulla mappa

Regione
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 170 121,60
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