Obiettivo
The research field of proteomics proceeds rapidly thanks to recent technological advances of instrumentation, methodology,
and software development. Next Generation Proteomics (NGP) refers to the integration of these three areas to provide a
systematic approach for measuring proteome dynamics in both time and space during various cellular responses. In this
proposal, I will analyze pre-ribosomal proteome dynamics in response to intracellular energy status using a NGP approach.
Specifically, I will determine how cancer cells regulate Ribosome Biogenesis (RiBi) to aid their survival under conditions of
energy deprivation, which frequently occurs in connection with solid tumour development. The host laboratory is well known
for developing and applying NGP strategies and will provide me with training and access to all of the equipment and
resources required. To carry out this project I will first optimise methods for purification of human pre-ribosomal particles,
combining my existing knowledge of RiBi with expertise from the Lamond group in nucleolar isolation. I will then use a
quantitative proteomics approach to analyze pre-ribosomes isolated from cells grown under conditions of varied glucose
deprivation. I will compare the components of pre-40S, pre-60S and pre-90S particles, respectively, using SILAC and the
PepTracker software developed in the Lamond group. This project is based on my recent data showing that 47S pre-rRNA
processing, which occurs in pre-90S particles, is suppressed by glucose deprivation in human adenocarcinoma HeLa and
MCF7 cell lines. As the proteins contained in human pre-ribosomes are less well characterised than the corresponding
yeast proteins, I will incorporate these results in a searchable database of human RiBi factors that will be freely available to
the community. As RiBi is the most energy-consuming process in eukaryotic cell the results of this project may lead to novel
cancer treatment strategies which target deregulation of RiBi.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia electron microscopy
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione software sviluppo software
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze chimiche chimica analitica spettrometria di massa
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
DD1 4HN Dundee
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.