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Transposable element Impacts on Gene Expression and Regulation

Obiettivo

Transposable elements (TEs) are DNA sequences that are able to spread within and between genomes. While transposition may lead to evident harmful effects, TEs can also positively impact the host genome by, for instance, donating intrinsic regulatory elements such as promoters. The main goal of this research project is to understand the regulatory changes that TEs engage within host genomes. While in mammals TE-derived promoters are often observed, only recently Drosophila TEs were described as potential platforms of gene regulatory networks, opening a new field for important discoveries. Since TEs are extremely active in fruit flies and Drosophila is found worldwide, TE copies that are population-specific are observed. Drosophila constitutes therefore a perfect model to study the impact of TEs in the host transcriptome. We hypothesize that Drosophila TEs are able to act as gene promoters and cause differential gene expression between wild-derived strains. Our first aim is to discover strain-specific TE-derived promoters involved in differential gene expression between Drosophila melanogaster populations by using a genome-wide high throughput sequencing method named RAMPAGE. In our second aim we will determine how histone modifications regulate TE-derived promoters by producing chromatin maps for each strain studied. The comparison of full sites (sites containing the insertion of a TE in one population) with empty sites (sites devoid of a TE insertion in another population) allow us to clearly demonstrate the impact and regulation of TE promoters.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSITE LYON 1 CLAUDE BERNARD
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 185 076,00
Indirizzo
BOULEVARD DU 11 NOVEMBRE 1918 NUM43
69622 Villeurbanne Cedex
Francia

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Regione
Auvergne-Rhône-Alpes Rhône-Alpes Rhône
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 185 076,00
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