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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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A DUAL gRNA system for functional assessment of ENhancers in Pluripotency

Obiettivo

Enhancers are cis-regulatory genomic regions that can modulate gene expression in a cell type-specific and time-controlled manner to regulate cellular behaviour. ChIP-seq and RNA-seq technologies have allowed genome-wide identification of potential enhancers based on the correlation among specific chromatin marks, transcription factor biding sites and gene expression. However, strategies to validate their function are still limited. Recently, it has been demonstrated that the CRISPR/Cas9 genome editing technology can be used to delete large genomic regions at high frequency by co-transfection of two guide RNAs (gRNAs) targeting collinear genomic sites and subsequent NHEJ-mediated repair. Nevertheless, this system is limited to individual tests. Here we aim to generate a novel lentiviral dual-gRNA expression system that enables large scale functional enhancer screening. The candidate will apply this dual-gRNA expression system to generate custom libraries that will allow the functional identification and subsequent validation of essential enhancers for the maintenance of mouse Embryonic Stem (mES) cell identity. This technology will provide a comprehensive view of the function of enhancers within their genomic context and will enable for the first time the performance of systematic, genetic forward enhancer screens.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 183 454,80
Indirizzo
OLD COLLEGE, SOUTH BRIDGE
EH8 9YL Edinburgh
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
Scotland Eastern Scotland Edinburgh
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 183 454,80
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