Objetivo
"Transcription is a stepwise process that is inherently dynamic. Different types of transcription factors are continuously interacting off and onto DNA, ""searching"" for appropriate interactions - each bringing different functions into play. The rates with which these factors interact with chromatin, their association and dissociation rates, dictate the outcome of ""steady-state"", developmental and rapidly responsive regulatory programs. Given the central role of transcription factors in biology and disease, it is remarkable that we know next to nothing about the dynamics of transcription factor-chromatin interactions.
The objective of DynaMech is to implement technologies that will allow us to measure transcription factor binding dynamics (on- and off-rates) genome-wide, at binding site resolution. This will be applied to gain a systematic understanding of how these dynamics effect the function of transcription factors. Analyses will encompass components of the RNA polymerase II pre-initiation complex in yeast, as well as a comprehensive set of gene-specific transcription factors. For each of these factors we will determine the on- and off-rates genome-wide as well as the degree to which the mRNA synthesis rates from all promoters are dependent on the factor. This data will all be analysed in the context of nucleosome binding dynamics to understand the general principles of how chromatin-transcripton factor binding dynamics shape regulatory mechanisms. Through modelling promoter output and by additional perturbations, these principles will be explored to understand which properties of regulatory DNA determine differential transcription factor dynamics thereby causing differential promoter behaviour.
We are as yet far from predicting regulatory outcome from regulatory sequence. The long-term aim of this work is to bring this closer, by bringing into play the almost completely unexplored aspect of transcription factor-chromatin interaction dynamics.
"
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2014-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
3584CS Utrecht
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.