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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Less is more: Single Cell Analysis of Zebrafish Blood Development

Objectif

Blood stem cells need to both perpetuate themselves (self-renew) and differentiate into all mature blood cells to maintain blood formation throughout life. However, it is unclear how the underlying gene regulatory network maintains this population of self-renewing and differentiating stem cells, and how it accommodates the transition from a stem cell to a mature blood cell. Our current knowledge of transcriptomes of various blood cell types has mainly been advanced by population-level analysis. However, the population of seemingly homogenous blood cells may include many distinct cell types with substantially different transcriptomes and abilities to make diverse fate decisions. To overcome these limitations, I will use single-cell transcriptome sequencing of zebrafish blood cells. I will apply an integrative strategy, combining genetic perturbation with computational sequence and network analysis methods, to reconstruct the regulatory networks that maintain the dynamic balance between different blood cell types. This will be achieved by pursuing two main aims:

1) I will create a comprehensive atlas of single cell gene expression in adult zebrafish blood cells and computationally reconstruct the blood lineage tree. I will order cells according to their most likely developmental chronology and identify genes and gene regulatory networks that define distinct cell types. The completion of the first aim will be followed by a more ambitious long-term one that is based on:
2) The in-depth functional characterisation of a subset of novel key regulators of blood formation and identified cell types in vivo. To achieve this I will generate a number of loss-of-function and transgenic zebrafish lines.

By sequencing thousands of single cells, this study is poised to go beyond traditional approaches in examining the complex relationships between the continuous spectra of blood cells, and will provide unprecedented insight into the regulation of blood cell formation.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-STG - Starting Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2015-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 500 000,00
Adresse
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni

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Région
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 500 000,00

Bénéficiaires (1)

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