Less is more: Single Cell Analysis of Zebrafish Blood Development

Informations projet

ZF_Blood

N° de convention de subvention: 677501

DOI

10.3030/677501

Projet clôturé

Date de signature de la CE 16 Février 2016

Date de début 1 Mai 2016

Date de fin 30 Avril 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 1 500 000,00

Coordonné par

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (8)

Analysis of endothelial-to-haematopoietic transition at the single cell level identifies cell cycle regulation as a driver of differentiation

Auteurs: Giovanni Canu, Emmanouil Athanasiadis, Rodrigo A. Grandy, Jose Garcia-Bernardo, Paulina M. Strzelecka, Ludovic Vallier, Daniel Ortmann, Ana Cvejic
Publié dans: Genome Biology, Numéro 21/1, 2020, ISSN 1474-760X
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-020-02058-4

Unsupervised generative and graph representation learning for modelling cell differentiation

Auteurs: Ioana Bica, Helena Andrés-Terré, Ana Cvejic, Pietro Liò
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-66166-8

Single-cell transcriptome analysis of fish immune cells provides insight into the evolution of vertebrate immune cell types

Auteurs: Santiago J. Carmona, Sarah A. Teichmann, Lauren Ferreira, Iain C. Macaulay, Michael J.T. Stubbington, Ana Cvejic, David Gfeller
Publié dans: Genome Research, Numéro 27/3, 2017, Page(s) 451-461, ISSN 1088-9051
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.207704.116

Single-cell RNA-sequencing uncovers transcriptional states and fate decisions in haematopoiesis

Auteurs: Emmanouil I. Athanasiadis, Jan G. Botthof, Helena Andres, Lauren Ferreira, Pietro Lio, Ana Cvejic
Publié dans: Nature Communications, Numéro 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-02305-6

CD4-Transgenic Zebrafish Reveal Tissue-Resident Th2- and Regulatory T Cell–like Populations and Diverse Mononuclear Phagocytes

Auteurs: Christopher T. Dee, Raghavendar T. Nagaraju, Emmanouil I. Athanasiadis, Caroline Gray, Laura Fernandez del Ama, Simon A. Johnston, Christopher J. Secombes, Ana Cvejic, Adam F. L. Hurlstone
Publié dans: The Journal of Immunology, Numéro 197/9, 2016, Page(s) 3520-3530, ISSN 0022-1767
Éditeur: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.1600959

Power analysis of single-cell RNA-sequencing experiments

Auteurs: Valentine Svensson, Kedar Nath Natarajan, Lam-Ha Ly, Ricardo J Miragaia, Charlotte Labalette, Iain C Macaulay, Ana Cvejic, Sarah A Teichmann
Publié dans: Nature Methods, Numéro 14/4, 2017, Page(s) 381-387, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4220

Single-cell transcriptional analysis reveals ILC-like cells in zebrafish

Auteurs: Pedro P. Hernández, Paulina M. Strzelecka, Emmanouil I. Athanasiadis, Dominic Hall, Ana F. Robalo, Catherine M. Collins, Pierre Boudinot, Jean-Pierre Levraud, Ana Cvejic
Publié dans: Science Immunology, Numéro 3/29, 2018, Page(s) eaau5265, ISSN 2470-9468
Éditeur: AAAS
DOI: 10.1126/sciimmunol.aau5265

A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma

Auteurs: Felipe A. Vieira Braga, Gozde Kar, Marijn Berg, Orestes A. Carpaij, Krzysztof Polanski, Lukas M. Simon, Sharon Brouwer, Tomás Gomes, Laura Hesse, Jian Jiang, Eirini S. Fasouli, Mirjana Efremova, Roser Vento-Tormo, Carlos Talavera-López, Marnix R. Jonker, Karen Affleck, Subarna Palit, Paulina M. Strzelecka, Helen V. Firth, Krishnaa T. Mahbubani, Ana Cvejic, Kerstin B. Meyer, Kourosh Saeb-Parsy, M
Publié dans: Nature Medicine, 2019, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-019-0468-5