Objetivo
The transition from euchromatin to heterochromatin is a fundamental process that particularly reshaped the epigenomic landscape of Y chromosome. Its definitive genomic underpinning and broad functional impact are still unclear, as heterochromatin (e.g. that of human Y) is usually too repetitive to study. I have previously demonstrated that, the young Y (‘neo-Y’) chromosome of Drosophila miranda has just initiated such a transition, thus is a powerful model to unveil the evolution, regulation and functional interaction of heterochromatin. I showed that this neo-Y still harbours over 1800 genes, and only 20-50% of the sequences are transposable elements (TE). Over five years, I aim to: 1) precisely resolve the structure and insertion sites of TEs as a pre-requisite for studying heterochromatin, by combining state-of-art sequencing and bioinformatic techniques. 2) I will reveal the de novo heterochromatin formation triggered by TE insertions or the heterochromatin/euchromatin boundary shifts on the neo-Y, by comparing the binding profiles of histone modification hallmarks and insulator proteins of D. miranda to its sibling species D. pseudoobscura, which lacks the neo-Y. Such epigenomic changes have likely driven the exaptation or innovation of small RNA pathways that govern the TE mobility. 3) I will then identify the responsible small RNAs and their encoding loci, which are expected to have newly emerged or differentially expressed in D. miranda relative to D. pseudoobscura. 4) Finally, I will develop CRISPR/Cas9 in D. miranda to manipulate the expression of TEs encoding such small RNAs on the neo-Y, in order to scrutinize how TE/heterochromatin evolution on the Y would impact the chromatin landscape of the entire host genome. The combined aim of this multidisciplinary project is to generate a framework for understanding the basic mechanisms of how heterochromatin evolves; and open a new avenue toward the discovery of Y chromosome function beyond male determination.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular evolución molecular
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma genoma eucariota
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-STG - Starting Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2015-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1010 Wien
Austria
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.