Descripción del proyecto
En busca de nuevos mecanismos de defensa antibacteriófagos
Las bacterias han desarrollado mecanismos de defensa contra los bacteriófagos, como las enzimas de restricción y CRISPR-Cas, lo que ha influido de forma notable en la evolución de ambas especies. Sin embargo, se especula mucho sobre la existencia de una gran batería de sistemas de defensa antibacteriófagos aún no caracterizados en los genomas bacterianos. En el proyecto PhageResist, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se pretende estudiar de forma sistemática la presencia de mecanismos adicionales empleados por las bacterias en su lucha contra los bacteriófagos. En esta búsqueda, los investigadores utilizarán la genómica computacional, la biología sintética y experimentos genéticos y bioquímicos. Los resultados del proyecto no solo mejorarán la comprensión de las interacciones entre bacterias y bacteriófagos, sino que además pueden contribuir a nuevas aplicaciones de ingeniería genética.
Objetivo
The perpetual arms race between bacteria and phage has resulted in the evolution of efficient resistance systems that protect bacteria from phage infection. Such systems, which include restriction enzymes and CRISPR-Cas, have major influence on the evolution of both bacteria and phage, and have also proven to be invaluable for molecular and biotechnological applications. Although much have been learned on the biology of bacterial defense against phage, more than half of all sequenced bacteria do not contain CRISPR-Cas, and it is estimated that many additional, yet-uncharacterized anti-phage defense systems are encoded in bacterial genomes.
The goal of this project is to systematically understand the arsenal of defense mechanisms that are at the disposal of microbes in their struggle against phages. The project combines computational genomics, synthetic biology, high-throughput robotic assays, and deep genetic and biochemical experiments to discover, verify, and study the properties of anti-phage defense systems.
Ámbito científico
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriology
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologyvirology
- natural sciencesmathematicspure mathematicsdiscrete mathematicsgraph theory
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsenzymes
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-COG - Consolidator GrantInstitución de acogida
7610001 Rehovot
Israel