Descrizione del progetto
Alla ricerca di nuovi meccanismi di difesa antifagici
I batteri hanno evoluto meccanismi di difesa contro i fagi, come gli enzimi di restrizione e il CRISPR-Cas, influenzando notevolmente l’evoluzione di entrambe le specie. Tuttavia, si ipotizza l’esistenza di un’ampia batteria di sistemi di difesa antifagici non ancora caratterizzati nei genomi batterici. Il progetto PhageResist, finanziato dal Consiglio europeo della ricerca, si propone di indagare sistematicamente la presenza di meccanismi aggiuntivi impiegati dai microbi nella loro lotta contro i fagi. In questa ricerca, i ricercatori ricorreranno alla genomica computazionale, alla biologia sintetica e a esperimenti genetici e biochimici. Oltre a migliorare la nostra comprensione delle interazioni fra batteri e fagi, i risultati del progetto potrebbero contribuire a nuove applicazioni di ingegneria genetica.
Obiettivo
The perpetual arms race between bacteria and phage has resulted in the evolution of efficient resistance systems that protect bacteria from phage infection. Such systems, which include restriction enzymes and CRISPR-Cas, have major influence on the evolution of both bacteria and phage, and have also proven to be invaluable for molecular and biotechnological applications. Although much have been learned on the biology of bacterial defense against phage, more than half of all sequenced bacteria do not contain CRISPR-Cas, and it is estimated that many additional, yet-uncharacterized anti-phage defense systems are encoded in bacterial genomes.
The goal of this project is to systematically understand the arsenal of defense mechanisms that are at the disposal of microbes in their struggle against phages. The project combines computational genomics, synthetic biology, high-throughput robotic assays, and deep genetic and biochemical experiments to discover, verify, and study the properties of anti-phage defense systems.
Campo scientifico
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriology
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiologyvirology
- natural sciencesmathematicspure mathematicsdiscrete mathematicsgraph theory
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsenzymes
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
ERC-COG - Consolidator GrantIstituzione ospitante
7610001 Rehovot
Israele