Exploring and exploiting the potential of extinct genome sequencing

Projektinformationen

Extinction Genomics

ID Finanzhilfevereinbarung: 681396

DOI

10.3030/681396

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 29 März 2016

Startdatum 1 April 2016

Enddatum 31 März 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 000 000,00

EU-Beitrag

€ 2 000 000,00

Koordiniert durch

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (39)

Early Pleistocene enamel proteome from Dmanisi resolves Stephanorhinus phylogeny

Autoren: Enrico Cappellini, Frido Welker, Luca Pandolfi, Jazmín Ramos-Madrigal, Diana Samodova, Patrick L. Rüther, Anna K. Fotakis, David Lyon, J. Víctor Moreno-Mayar, Maia Bukhsianidze, Rosa Rakownikow Jersie-Christensen, Meaghan Mackie, Aurélien Ginolhac, Reid Ferring, Martha Tappen, Eleftheria Palkopoulou, Marc R. Dickinson, Thomas W. Stafford, Yvonne L. Chan, Anders Götherström, Senthilvel K. S.
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 574/7776, 2019, Seite(n) 103-107, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1555-y

Ancient RNA from Late Pleistocene permafrost and historical canids shows tissue-specific transcriptome survival

Autoren: Oliver Smith, Glenn Dunshea, Mikkel-Holger S. Sinding, Sergey Fedorov, Mietje Germonpre, Hervé Bocherens, M. T. P. Gilbert
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 17/7, 2019, Seite(n) e3000166, ISSN 1545-7885
Herausgeber: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000166

DNA metabarcoding and spatial modelling link diet diversification with distribution homogeneity in European bats

Autoren: Antton Alberdi, Orly Razgour, Ostaizka Aizpurua, Roberto Novella-Fernandez, Joxerra Aihartza, Ivana Budinski, Inazio Garin, Carlos Ibáñez, Eñaut Izagirre, Hugo Rebelo, Danilo Russo, Anton Vlaschenko, Violeta Zhelyazkova, Vida Zrnčić, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14961-2

Genomes of Pleistocene Siberian Wolves Uncover Multiple Extinct Wolf Lineages

Autoren: Jazmín Ramos-Madrigal, Mikkel-Holger S. Sinding, Christian Carøe, Sarah S.T. Mak, Jonas Niemann, José A. Samaniego Castruita, Sergey Fedorov, Alexander Kandyba, Mietje Germonpré, Hervé Bocherens, Tatiana R. Feuerborn, Vladimir V. Pitulko, Elena Y. Pavlova, Pavel A. Nikolskiy, Aleksei K. Kasparov, Varvara V. Ivanova, Greger Larson, Laurent A.F. Frantz, Eske Willerslev, Morten Meldgaard, Bent P
Veröffentlicht in: Current Biology, 2020, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.10.002

Using in silico predicted ancestral genomes to improve the efficiency of paleogenome reconstruction

Autoren: Filipe Garrett Vieira, José Alfredo Samaniego Castruita, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Ecology and Evolution, 2020, ISSN 2045-7758
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.6925

Extended survival of Pleistocene Siberian wolves into the early 20th century on the island of Honshū

Autoren: Jonas Niemann, Shyam Gopalakrishnan, Nobuyuki Yamaguchi, Jazmín Ramos-Madrigal, Nathan Wales, M. Thomas P. Gilbert, Mikkel-Holger S. Sinding
Veröffentlicht in: iScience, Ausgabe 24/1, 2021, Seite(n) 101904, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.isci.2020.101904

Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

Autoren: Shaohong Feng; Josefin Stiller; Yuan Deng; Joel Armstrong; Qi Fang; Andrew Hart Reeve; Duo Xie; Guangji Chen; Chunxue Guo; Brant C. Faircloth; Bent Petersen; Zongji Wang; Qi Zhou; Mark Diekhans; Wanjun Chen; Sergio Andreu-Sánchez; Ashot Margaryan; Jason Travis Howard; Carole Parent; George Pacheco; Mikkel-Holger S. Sinding; Lara Puetz; Emily Cavill; Ângela M. Ribeiro; Leopold Eckhart; Jon Fjelds
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 587, 2020, Seite(n) 252-257, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2873-9

The evolutionary history of extinct and living lions

Autoren: Marc de Manuel, Ross Barnett, Marcela Sandoval-Velasco, Nobuyuki Yamaguchi, Filipe Garrett Vieira, M. Lisandra Zepeda Mendoza, Shiping Liu, Michael D. Martin, Mikkel-Holger S. Sinding, Sarah S. T. Mak, Christian Carøe, Shanlin Liu, Chunxue Guo, Jiao Zheng, Grant Zazula, Gennady Baryshnikov, Eduardo Eizirik, Klaus-Peter Koepfli, Warren E. Johnson, Agostinho Antunes, Thomas Sicheritz-Ponten, Shyam
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 117/20, 2020, Seite(n) 10927-10934, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1919423117

Plasmodium vivax Malaria Viewed through the Lens of an Eradicated European Strain

Autoren: Lucy van Dorp, Pere Gelabert, Adrien Rieux, Marc de Manuel, Toni de-Dios, Shyam Gopalakrishnan, Christian Carøe, Marcela Sandoval-Velasco, Rosa Fregel, Iñigo Olalde, Raül Escosa, Carles Aranda, Silvie Huijben, Ivo Mueller, Tomàs Marquès-Bonet, François Balloux, M Thomas P Gilbert, Carles Lalueza-Fox
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 37/3, 2019, Seite(n) 773-785, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msz264

Genomic Adaptations and Evolutionary History of the Extinct Scimitar-Toothed Cat, Homotherium latidens

Autoren: Ross Barnett, Michael V. Westbury, Marcela Sandoval-Velasco, Filipe Garrett Vieira, Sungwon Jeon, Grant Zazula, Michael D. Martin, Simon Y.W. Ho, Niklas Mather, Shyam Gopalakrishnan, Jazmín Ramos-Madrigal, Marc de Manuel, M. Lisandra Zepeda-Mendoza, Agostinho Antunes, Aldo Carmona Baez, Binia De Cahsan, Greger Larson, Stephen J. O’Brien, Eduardo Eizirik, Warren E. Johnson, Klaus-Peter Koepfli,
Veröffentlicht in: Current Biology, 2020, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.09.051

Hi-C chromosome conformation capture sequencing of avian genomes using the BGISEQ-500 platform

Autoren: Marcela Sandoval-Velasco, Juan Antonio Rodríguez, Cynthia Perez Estrada, Guojie Zhang, Erez Lieberman Aiden, Marc A Marti-Renom, M Thomas P Gilbert, Oliver Smith
Veröffentlicht in: GigaScience, Ausgabe 9/8, 2020, ISSN 2047-217X
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/gigascience/giaa087

Demographic reconstruction from ancient DNA supports rapid extinction of the great auk

Autoren: Jessica E Thomas, Gary R Carvalho, James Haile, Nicolas J Rawlence, Michael D Martin, Simon YW Ho, Arnór Þ Sigfússon, Vigfús A Jósefsson, Morten Frederiksen, Jannie F Linnebjerg, Jose A Samaniego Castruita, Jonas Niemann, Mikkel-Holger S Sinding, Marcela Sandoval-Velasco, André ER Soares, Robert Lacy, Christina Barilaro, Juila Best, Dirk Brandis, Chiara Cavallo, Mikelo Elorza, Kimball L Garr
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 8, 2019, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.47509

Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene–Holocene transition

Autoren: Mikkel-Holger S. Sinding, Shyam Gopalakrishnan, Jazmín Ramos-Madrigal, Marc de Manuel, Vladimir V. Pitulko, Lukas Kuderna, Tatiana R. Feuerborn, Laurent A. F. Frantz, Filipe G. Vieira, Jonas Niemann, Jose A. Samaniego Castruita, Christian Carøe, Emilie U. Andersen-Ranberg, Peter D. Jordan, Elena Y. Pavlova, Pavel A. Nikolskiy, Aleksei K. Kasparov, Varvara V. Ivanova, Eske Willerslev, Pontus Skog
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 368/6498, 2020, Seite(n) 1495-1499, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aaz8599

A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives

Autoren: Michael V Westbury, Ross Barnett, Marcela Sandoval-Velasco, Graham Gower, Filipe Garrett Vieira, Marc de Manuel, Anders J Hansen, Nobuyuki Yamaguchi, Lars Werdelin, Tomas Marques-Bonet, M Thomas P Gilbert, Eline D Lorenzen
Veröffentlicht in: Open Research Europe, Ausgabe 1, 2021, Seite(n) 25, ISSN 2732-5121
Herausgeber: Directorate-General for DG RTD
DOI: 10.12688/openreseurope.13104.1

Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet

Autoren: Pere Gelabert, Marcela Sandoval-Velasco, Aitor Serres, Marc de Manuel, Pere Renom, Ashot Margaryan, Josefin Stiller, Toni de-Dios, Qi Fang, Shaohong Feng, Santi Mañosa, George Pacheco, Manuel Ferrando-Bernal, Guolin Shi, Fei Hao, Xianqing Chen, Bent Petersen, Remi-André Olsen, Arcadi Navarro, Yuan Deng, Love Dalén, Tomàs Marquès-Bonet, Guojie Zhang, Agostinho Antunes, M. Thomas P. Gilbert, Ca
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 30/1, 2020, Seite(n) 108-114.e5, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2019.10.066

Pre-extinction Demographic Stability and Genomic Signatures of Adaptation in the Woolly Rhinoceros

Autoren: Edana Lord, Nicolas Dussex, Marcin Kierczak, David Díez-del-Molino, Oliver A. Ryder, David W.G. Stanton, M. Thomas P. Gilbert, Fátima Sánchez-Barreiro, Guojie Zhang, Mikkel-Holger S. Sinding, Eline D. Lorenzen, Eske Willerslev, Albert Protopopov, Fedor Shidlovskiy, Sergey Fedorov, Hervé Bocherens, Senthilvel K.S.S. Nathan, Benoit Goossens, Johannes van der Plicht, Yvonne L. Chan, Stefan Prost,
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 30/19, 2020, Seite(n) 3871-3879.e7, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.07.046

Mitochondrial DNA from the eradicated European Plasmodium vivax and P. falciparum from 70-year-old slides from the Ebro Delta in Spain

Autoren: Pere Gelabert, Marcela Sandoval-Velasco, Iñigo Olalde, Rosa Fregel, Adrien Rieux, Raül Escosa, Carles Aranda, Krijn Paaijmans, Ivo Mueller, M. Thomas P. Gilbert, Carles Lalueza-Fox
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 113/41, 2016, Seite(n) 11495-11500, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1611017113

The Draft Genome of Extinct European Aurochs and its Implications for De-Extinction

Autoren: Mikkel-Holger S. Sinding, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Open Quaternary, Ausgabe 2, 2016, Seite(n) 1-9, ISSN 2055-298X
Herausgeber: Ubiquity Press
DOI: 10.5334/oq.25

The potential and pitfalls of de-extinction

Autoren: Douglas J. Richmond, Mikkel-Holger S. Sinding, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Zoologica Scripta, Ausgabe 45, 2016, Seite(n) 22-36, ISSN 0300-3256
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/zsc.12212

Quantifying Temporal Genomic Erosion in Endangered Species

Autoren: David Díez-del-Molino, Fatima Sánchez-Barreiro, Ian Barnes, M. Thomas P. Gilbert, Love Dalén
Veröffentlicht in: Trends in Ecology & Evolution, Ausgabe 33/3, 2018, Seite(n) 176-185, ISSN 0169-5347
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tree.2017.12.002

Applied Hologenomics: Feasibility and Potential in Aquaculture

Autoren: Morten T. Limborg, Antton Alberdi, Miyako Kodama, Michael Roggenbuck, Karsten Kristiansen, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Trends in Biotechnology, Ausgabe 36/3, 2018, Seite(n) 252-264, ISSN 0167-7799
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2017.12.006

No longer locally extinct? Tracing the origins of a lion (Panthera leo) living in Gabon

Autoren: Ross Barnett, Mikkel-Holder S. Sinding, Filipe G. Vieira, Marie Lisandra Zepeda Mendoza, Matthieu Bonnet, Alessandro Araldi, Ivonne Kienast, Alice Zambarda, Nobuyuki Yamaguchi, Philipp Henschel, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Conservation Genetics, Ausgabe 19/3, 2018, Seite(n) 611-618, ISSN 1566-0621
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10592-017-1039-2

Hologenomic adaptations underlying the evolution of sanguivory in the common vampire bat

Autoren: M. Lisandra Zepeda Mendoza, Zijun Xiong, Marina Escalera-Zamudio, Anne Kathrine Runge, Julien Thézé, Daniel Streicker, Hannah K. Frank, Elizabeth Loza-Rubio, Shengmao Liu, Oliver A. Ryder, Jose Alfredo Samaniego Castruita, Aris Katzourakis, George Pacheco, Blanca Taboada, Ulrike Löber, Oliver G. Pybus, Yang Li, Edith Rojas-Anaya, Kristine Bohmann, Aldo Carmona Baez, Carlos F. Arias, Shiping Liu
Veröffentlicht in: Nature Ecology & Evolution, Ausgabe 2/4, 2018, Seite(n) 659-668, ISSN 2397-334X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41559-018-0476-8

The evolutionary history of dogs in the Americas

Autoren: Máire Ní Leathlobhair, Angela R. Perri, Evan K. Irving-Pease, Kelsey E. Witt, Anna Linderholm, James Haile, Ophelie Lebrasseur, Carly Ameen, Jeffrey Blick, Adam R. Boyko, Selina Brace, Yahaira Nunes Cortes, Susan J. Crockford, Alison Devault, Evangelos A. Dimopoulos, Morley Eldridge, Jacob Enk, Shyam Gopalakrishnan, Kevin Gori, Vaughan Grimes, Eric Guiry, Anders J. Hansen, Ardern Hulme-Beaman, J
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 361/6397, 2018, Seite(n) 81-85, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aao4776

Improved Genome Assembly and Annotation for the Rock Pigeon ( Columba livia )

Autoren: Carson Holt, Michael Campbell, David A. Keays, Nathaniel Edelman, Aurélie Kapusta, Emily Maclary, Eric T. Domyan, Alexander Suh, Wesley C. Warren, Mark Yandell, M. Thomas P. Gilbert, Michael D. Shapiro
Veröffentlicht in: "G3: Genes|Genomes|Genetics", Ausgabe 8/5, 2018, Seite(n) 1391-1398, ISSN 2160-1836
Herausgeber: Genetics Society of America
DOI: 10.1534/g3.117.300443

Interspecific Gene Flow Shaped the Evolution of the Genus Canis

Autoren: Shyam Gopalakrishnan, Mikkel-Holger S. Sinding, Jazmín Ramos-Madrigal, Jonas Niemann, Jose A. Samaniego Castruita, Filipe G. Vieira, Christian Carøe, Marc de Manuel Montero, Lukas Kuderna, Aitor Serres, Víctor Manuel González-Basallote, Yan-Hu Liu, Guo-Dong Wang, Tomas Marques-Bonet, Siavash Mirarab, Carlos Fernandes, Philippe Gaubert, Klaus-Peter Koepfli, Jane Budd, Eli Knispel Rueness, Mads
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 28/21, 2018, Seite(n) 3441-3449.e5, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2018.08.041

Ancient DNA analysis of Scandinavian medieval drinking horns and the horn of the last aurochs bull

Autoren: Maiken Hemme Bro-Jørgensen, Christian Carøe, Filipe G. Vieira, Sofia Nestor, Ann Hallström, Kristian M. Gregersen, Vivian Etting, M. Thomas P. Gilbert, Mikkel-Holger S. Sinding
Veröffentlicht in: Journal of Archaeological Science, Ausgabe 99, 2018, Seite(n) 47-54, ISSN 0305-4403
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jas.2018.09.001

Population genomics of grey wolves and wolf-like canids in North America

Autoren: Mikkel-Holger S. Sinding, Shyam Gopalakrishan, Filipe G. Vieira, Jose A. Samaniego Castruita, Katrine Raundrup, Mads Peter Heide Jørgensen, Morten Meldgaard, Bent Petersen, Thomas Sicheritz-Ponten, Johan Brus Mikkelsen, Ulf Marquard-Petersen, Rune Dietz, Christian Sonne, Love Dalén, Lutz Bachmann, Øystein Wiig, Anders J. Hansen, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 14/11, 2018, Seite(n) e1007745, ISSN 1553-7404
Herausgeber: PLoS.org
DOI: 10.1371/journal.pgen.1007745

The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested Ibis

Autoren: Shaohong Feng, Qi Fang, Ross Barnett, Cai Li, Sojung Han, Martin Kuhlwilm, Long Zhou, Hailin Pan, Yuan Deng, Guangji Chen, Anita Gamauf, Friederike Woog, Robert Prys-Jones, Tomas Marques-Bonet, M. Thomas P. Gilbert, Guojie Zhang
Veröffentlicht in: Current Biology, Ausgabe 29/2, 2019, Seite(n) 340-349.e7, ISSN 0960-9822
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2018.12.008

Mitogenomic evidence of close relationships between New Zealand’s extinct giant raptors and small-sized Australian sister-taxa

Autoren: Michael Knapp, Jessica E. Thomas, James Haile, Stefan Prost, Simon Y.W. Ho, Nicolas Dussex, Sophia Cameron-Christie, Olga Kardailsky, Ross Barnett, Michael Bunce, M. Thomas P. Gilbert, R. Paul Scofield
Veröffentlicht in: Molecular Phylogenetics and Evolution, Ausgabe 134, 2019, Seite(n) 122-128, ISSN 1055-7903
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ympev.2019.01.026

Eggshell palaeogenomics: Palaeognath evolutionary history revealed through ancient nuclear and mitochondrial DNA from Madagascan elephant bird ( Aepyornis sp.) eggshell

Autoren: Alicia Grealy, Matthew Phillips, Gifford Miller, M. Thomas P. Gilbert, Jean-Marie Rouillard, David Lambert, Michael Bunce, James Haile
Veröffentlicht in: Molecular Phylogenetics and Evolution, Ausgabe 109, 2017, Seite(n) 151-163, ISSN 1055-7903
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ympev.2017.01.005

The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics

Autoren: Shyam Gopalakrishnan, Jose A. Samaniego Castruita, Mikkel-Holger S. Sinding, Lukas F. K. Kuderna, Jannikke R?ikk?nen, Bent Petersen, Thomas Sicheritz-Ponten, Greger Larson, Ludovic Orlando, Tomas Marques-Bonet, Anders J. Hansen, Love Dal?n, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: BMC Genomics, Ausgabe 18/1, 2017, ISSN 1471-2164
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-017-3883-3

Comparative performance of the BGISEQ-500 versus Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing

Autoren: Sarah Siu Tze Mak, Shyam Gopalakrishnan, Christian Car?e, Chunyu Geng, Shanlin Liu, Mikkel-Holger S. Sinding, Lukas F.K. Kuderna, Wenwei Zhang, Shujin Fu, Filipe G. Vieira, Mietje Germonpr?, Herv? Bocherens, Sergey Fedorov, Bent Petersen, Thomas Sicheritz-Pont?n, Tomas Marques-Bonet, Guojie Zhang, Hui Jiang, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: GigaScience, 2017, ISSN 2047-217X
Herausgeber: OUP
DOI: 10.1093/gigascience/gix049

Whole-genome sequencing of African dogs provides insights into adaptations against tropical parasites

Autoren: Yan-Hu Liu, Lu Wang, Tao Xu, Xiaomin Guo, Yang Li, Ting-Ting Yin, He-Chuan Yang, Hu Yang, Adeniyi C. Adeola, Oscar J. Sanke, Newton O. Otecko, Meng Wang, Yaping Ma, Olaogun S. Charles, Mikkel-Holger S. Sinding, Shyam Gopalakrishnan, José Alfredo Samaniego, Anders J. Hansen, Carlos Fernandes, Philippe Gaubert, Jane Budd, Philip M. Dawuda, Eli Knispel Rueness, Lubin Jiang, Weiwei Zhai, M.T.P Gilber
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, 2017, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msx258

Single-tube library preparation for degraded DNA

Autoren: Christian Carøe, Shyam Gopalakrishnan, Lasse Vinner, Sarah S. T. Mak, Mikkel Holger S. Sinding, José A. Samaniego, Nathan Wales, Thomas Sicheritz-Pontén, M. Thomas P. Gilbert
Veröffentlicht in: Methods in Ecology and Evolution, 2017, ISSN 2041-210X
Herausgeber: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1111/2041-210X.12871

Recent mitochondrial lineage extinction in the critically endangered Javan rhinoceros

Autoren: Ashot Margaryan, Mikkel-Holger S Sinding, Shanlin Liu, Filipe Garrett Vieira, Yvonne L Chan, Senthilvel K S S Nathan, Yoshan Moodley, Michael W Bruford, M Thomas P Gilbert
Veröffentlicht in: Zoological Journal of the Linnean Society, Ausgabe 190/1, 2020, Seite(n) 372-383, ISSN 0024-4082
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1093/zoolinnean/zlaa004

Darwin’s Fancy Revised: An Updated Understanding of the Genomic Constitution of Pigeon Breeds

Autoren: George Pacheco, Hein van Grouw, Michael D Shapiro, Marcus Thomas P Gilbert, Filipe Garrett Vieira
Veröffentlicht in: Genome Biology and Evolution, Ausgabe 12/3, 2020, Seite(n) 136-150, ISSN 1759-6653
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evaa027

High-coverage genomes to elucidate the evolution of penguins

Autoren: Hailin Pan, Theresa L Cole, Xupeng Bi, Miaoquan Fang, Chengran Zhou, Zhengtao Yang, Daniel T Ksepka, Tom Hart, Juan L Bouzat, Lisa S Argilla, Mads F Bertelsen, P Dee Boersma, Charles-André Bost, Yves Cherel, Peter Dann, Steven R Fiddaman, Pauline Howard, Kim Labuschagne, Thomas Mattern, Gary Miller, Patricia Parker, Richard A Phillips, Petra Quillfeldt, Peter G Ryan, Helen Taylor, David R Thompso
Veröffentlicht in: GigaScience, Ausgabe 8/9, 2019, ISSN 2047-217X
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/gigascience/giz117

Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species

Autoren: Arang Rhie, Shane A. McCarthy, Olivier Fedrigo, Joana Damas, Giulio Formenti, Sergey Koren, Marcela Uliano-Silva, William Chow, Arkarachai Fungtammasan, Juwan Kim, Chul Lee, Byung June Ko, Mark Chaisson, Gregory L. Gedman, Lindsey J. Cantin, Francoise Thibaud-Nissen, Leanne Haggerty, Iliana Bista, Michelle Smith, Bettina Haase, Jacquelyn Mountcastle, Sylke Winkler, Sadye Paez, Jason Howard, Sonja
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 592/7856, 2021, Seite(n) 737-746, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03451-0