Objectif
Riboswitches are mRNA-based gene-regulatory elements triggered by direct interactions with small molecular ligands. They are exciting targets for novel antibiotic strategies. Many putative riboswitches have been identified using bioinformatics. However, ligand identification is getting more complicated since many motifs are not expected to be involved in simple feedback regulation mechanisms. For such “classical” riboswitches ligands have been assigned in the past based on testing metabolites selected by educated guesses guided by the associated gene contexts. We are convinced that this approach limits the identification of riboswitches that play regulatory roles in more complex bacterial processes such as virulence, detoxification, communication, and life style adaptations. Within this project, new riboswitch classes will be identified and characterized, paving the way for the development of antibiotics with novel modes of action.
We will establish a systematic, robust and unbiased approach for identifying intracellular RNA ligands by fishing small molecules from lysates as well as screening fractionated cellular extracts. The methodology shows great potential for assigning novel riboswitch classes since in preliminary experiments we have successfully isolated a small molecular activity that specifically triggers the ykkC orphan riboswitch motif. A range of analytical and preparative methods will be applied in order to identify the nature of this and further activities. By synthesizing ligands and derivatives thereof we will scout the antibiotic potential of novel riboswitch ligands. The proposed research is highly relevant for one of the major biomedical challenges of the coming decades: Since riboswitches are effective antibacterial targets, the identification of novel riboswitch / ligand interactions has immediate implications for establishing future antibiotic strategies necessary to keep in check the progressing problem of bacterial drug resistance.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
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ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2015-CoG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
78464 Konstanz
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.