Targeting replication stress recovery pathways in oncology

Informations projet

TENSION

N° de convention de subvention: 682421

DOI

10.3030/682421

Projet clôturé

Date de signature de la CE 1 Juillet 2016

Date de début 1 Août 2016

Date de fin 31 Juillet 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 972 500,00

Contribution de l’UE

€ 1 972 500,00

Coordonné par

ACADEMISCH ZIEKENHUIS GRONINGEN
Netherlands

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Publications

Peer reviewed articles (20)

Genomic instability, inflammatory signaling and response to cancer immunotherapy.

Auteurs: Mengting Chen; Renske Linstra; Marcel A. T. M. van Vugt
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer, Numéro 1, 2021, ISSN 0304-419X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbcan.2021.188661

Shaping the BRCAness mutational landscape by alternative double-strand break repair, replication stress and mitotic aberrancies

Auteurs: Colin Stok, Yannick P Kok, Nathalie van den Tempel, Marcel A T M van Vugt
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab151

Overexpression of Cyclin E1 or Cdc25A leads to replication stress, mitotic aberrancies, and increased sensitivity to replication checkpoint inhibitors

Auteurs: Yannick P. Kok, Sergi Guerrero Llobet, Pepijn M. Schoonen, Marieke Everts, Arkajyoti Bhattacharya, Rudolf S. N. Fehrmann, Nathalie van den Tempel, Marcel A. T. M. van Vugt
Publié dans: Oncogenesis, Numéro 9/10, 2020, ISSN 2157-9024
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41389-020-00270-2

Deposition Bias of Chromatin Proteins Inverts under DNA Replication Stress Conditions

Auteurs: Martijn R. H. Zwinderman; Thamar Jessurun Lobo; Petra E van der Wouden; Diana C.J. Spierings; Marcel A. T. M. van Vugt; Peter M. Lansdorp; Peter M. Lansdorp; Peter M. Lansdorp; Victor Guryev; Frank J. Dekker
Publié dans: ACS chemical biology, 16(11), 2193 - 2201. AMER CHEMICAL SOC, Numéro 1, 2021, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.1c00321

Premature mitotic entry induced by ATR inhibition potentiates olaparib inhibition‐mediated genomic instability, inflammatory signaling, and cytotoxicity in BRCA2‐deficient cancer cells

Auteurs: Pepijn M. Schoonen, Yannick P. Kok, Elles Wierenga, Bjorn Bakker, Floris Foijer, Diana C. J. Spierings, Marcel A. T. M. Vugt
Publié dans: Molecular Oncology, Numéro 13/11, 2019, Page(s) 2422-2440, ISSN 1574-7891
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1878-0261.12573

The RECQL helicase prevents replication fork collapse during replication stress

Auteurs: Bente Benedict, Marit AE van Bueren, Frank PA van Gemert, Cor Lieftink, Sergi Guerrero Llobet, Marcel ATM van Vugt, Roderick L Beijersbergen, Hein te Riele
Publié dans: Life Science Alliance, Numéro 3/10, 2020, Page(s) e202000668, ISSN 2575-1077
Éditeur: [Woodbury, NY] : Life Science Alliance, LLC, [2018]-
DOI: 10.26508/lsa.202000668

Transcriptional effects of copy number alterations in a large set of human cancers

Auteurs: Arkajyoti Bhattacharya, Rico D. Bense, Carlos G. Urzúa-Traslaviña, Elisabeth G. E. de Vries, Marcel A. T. M. van Vugt, Rudolf S. N. Fehrmann
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14605-5

Progression through mitosis promotes PARP inhibitor-induced cytotoxicity in homologous recombination-deficient cancer cells

Auteurs: Pepijn M. Schoonen, Francien Talens, Colin Stok, Ewa Gogola, Anne Margriet Heijink, Peter Bouwman, Floris Foijer, Madalena Tarsounas, Sohvi Blatter, Jos Jonkers, Sven Rottenberg, Marcel A. T. M. van Vugt
Publié dans: Nature Communications, Numéro 8, 2017, Page(s) 15981, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms15981

Shutting down the power supply for DNA repair in cancer cells

Auteurs: Marcel A.T.M. van Vugt
Publié dans: The Journal of Cell Biology, Numéro 216/2, 2017, Page(s) 295-297, ISSN 0021-9525
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201701026

Therapeutic targeting and patient selection for cancers with homologous recombination defects

Auteurs: Francien Talens, Mathilde Jalving, Jourik A. Gietema, Marcel A. Van Vugt
Publié dans: Expert Opinion on Drug Discovery, Numéro 12/6, 2017, Page(s) 565-581, ISSN 1746-0441
Éditeur: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2017.1322061

Identification of relevant drugable targets in diffuse large B-cell lymphoma using a genome-wide unbiased CD20 guilt-by association approach

Auteurs: Mathilde R. W. de Jong, Lydia Visser, Gerwin Huls, Arjan Diepstra, Marcel van Vugt, Emanuele Ammatuna, Rozemarijn S. van Rijn, Edo Vellenga, Anke van den Berg, Rudolf S. N. Fehrmann, Tom van Meerten
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 13/2, 2018, Page(s) e0193098, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0193098

TPX2/Aurora kinase A signaling as a potential therapeutic target in genomically unstable cancer cells

Auteurs: Stephanie E. van Gijn, Elles Wierenga, Nathalie van den Tempel, Yannick P. Kok, Anne Margriet Heijink, Diana C. J. Spierings, Floris Foijer, Marcel A. T. M. van Vugt, Rudolf S. N. Fehrmann
Publié dans: Oncogene, Numéro 38/6, 2019, Page(s) 852-867, ISSN 0950-9232
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41388-018-0470-2

BRCA2 deficiency instigates cGAS-mediated inflammatory signaling and confers sensitivity to tumor necrosis factor-alpha-mediated cytotoxicity

Auteurs: Anne Margriet Heijink, Francien Talens, Lucas T. Jae, Stephanie E. van Gijn, Rudolf S. N. Fehrmann, Thijn R. Brummelkamp, Marcel A. T. M. van Vugt
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-07927-y

Identification of Two Protein-Signaling States Delineating Transcriptionally Heterogeneous Human Medulloblastoma

Auteurs: Walderik W. Zomerman, Sabine L.A. Plasschaert, Siobhan Conroy, Frank J. Scherpen, Tiny G.J. Meeuwsen-de Boer, Harm J. Lourens, Sergi Guerrero Llobet, Marlinde J. Smit, Lorian Slagter-Menkema, Annika Seitz, Corrie E.M. Gidding, Esther Hulleman, Pieter Wesseling, Lisethe Meijer, Leon C. van Kempen, Anke van den Berg, Daniël O. Warmerdam, Frank A.E. Kruyt, Floris Foijer, Marcel A.T.M. van Vugt, Wilf
Publié dans: Cell Reports, Numéro 22/12, 2018, Page(s) 3206-3216, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2018.02.089

Selective Loss of PARG Restores PARylation and Counteracts PARP Inhibitor-Mediated Synthetic Lethality

Auteurs: Ewa Gogola, Alexandra A. Duarte, Julian R. de Ruiter, Wouter W. Wiegant, Jonas A. Schmid, Roebi de Bruijn, Dominic I. James, Sergi Guerrero Llobet, Daniel J. Vis, Stefano Annunziato, Bram van den Broek, Marco Barazas, Ariena Kersbergen, Marieke van de Ven, Madalena Tarsounas, Donald J. Ogilvie, Marcel van Vugt, Lodewyk F.A. Wessels, Jirina Bartkova, Irina Gromova, Miguel Andújar-Sánchez, Jiri Ba
Publié dans: Cancer Cell, Numéro 33/6, 2018, Page(s) 1078-1093.e12, ISSN 1535-6108
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.ccell.2018.05.008

RIF1 promotes replication fork protection and efficient restart to maintain genome stability

Auteurs: Chirantani Mukherjee, Vivek Tripathi, Eleni Maria Manolika, Anne Margriet Heijink, Giulia Ricci, Sarra Merzouk, H. Rudolf de Boer, Jeroen Demmers, Marcel A. T. M. van Vugt, Arnab Ray Chaudhuri
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-11246-1

Inflammatory signaling in genomically instable cancers

Auteurs: Francien Talens, Marcel A.T.M. Van Vugt
Publié dans: Cell Cycle, Numéro 18/16, 2019, Page(s) 1830-1848, ISSN 1538-4101
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15384101.2019.1638192

Modeling of Cisplatin-Induced Signaling Dynamics in Triple-Negative Breast Cancer Cells Reveals Mediators of Sensitivity

Auteurs: Anne Margriet Heijink, Marieke Everts, Megan E. Honeywell, Ryan Richards, Yannick P. Kok, Elisabeth G.E. de Vries, Michael J. Lee, Marcel A.T.M. van Vugt
Publié dans: Cell Reports, Numéro 28/9, 2019, Page(s) 2345-2357.e5, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.070

Cyclin E expression is associated with high levels of replication stress in triple-negative breast cancer

Auteurs: Sergi Guerrero Llobet, Bert van der Vegt, Evelien Jongeneel, Rico D. Bense, Mieke C. Zwager, Carolien P. Schröder, Marieke Everts, Rudolf S. N. Fehrmann, Geertruida H. de Bock, Marcel A. T. M. van Vugt
Publié dans: npj Breast Cancer, Numéro 6/1, 2020, ISSN 2374-4677
Éditeur: New York, NY : Breast Cancer Research Foundation : Nature Publishing Group, [2015]-
DOI: 10.1038/s41523-020-00181-w

Improving gene function predictions using independent transcriptional components

Auteurs: Carlos G. Urzúa-Traslaviña, Vincent C. Leeuwenburgh, Arkajyoti Bhattacharya, Stefan Loipfinger, Marcel A. T. M. van Vugt, Elisabeth G. E. de Vries, Rudolf S. N. Fehrmann
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21671-w

Non-peer reviewed articles (1)

Never tear us a-PARP: Dealing with DNA lesions during mitosis

Auteurs: Pepijn M. Schoonen, Marcel A.T.M. van Vugt
Publié dans: Molecular & Cellular Oncology, Numéro 5/1, 2017, Page(s) e1382670, ISSN 2372-3556
Éditeur: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/23723556.2017.1382670

Book chapters (1)

Replication stress: Driver and therapeutic target in genomically instable cancers

Auteurs: Pepijn M. Schoonen, Sergi Guerrero Llobet, Marcel A.T.M. van Vugt
Publié dans: DNA Repair, Numéro 115, 2019, Page(s) 157-201, ISBN 9780-128155592
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.apcsb.2018.10.006