CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.
Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .
Livrables
Benchmark the performance in peptide and protein identifications of EThcD versus HCD peptides from complex mixtures, whereby the Mw of the peptides is in the range between 2.5 and 10 kDa (middle-down proteomics)
Software module for comprehensive identification of PTMs, mutations and splice variants (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Implement genome-informed proteomics platform that incorporates knowledge on human natural variations, disease mutations and alternative splicing. Ensure efficiency of search algorithm in huge protein/peptide spaces further inflated by multiple PTMs.
Software module for multiplexed quantification of clinical samples (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Develop and test software module that enables low variance quantification in body fluid and tissue samples for MS1 and MS2 label and label free quantification for hundreds of patients simultaneously.
Extension of software module to novel/hybrid fragmentation methods (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Develop peptide identification algorithms for EThcD, UVPD and other novel techniques with competitive identification rates. Incorporation in the MaxQuant software.
Industrialized workflow with low CVs (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Develop and test a workflow that enables robust analysis of hundreds of tissue and body fluid samples with minimal intervention and CVs in the smaller than 20% range for proteins of interest
Feasibility study in cancer tissue proteomics (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Perform large-scale quantitative phosphoproteomics of patient samples from ovarian cancer, colon cancer and prostate cancer samples using the protocols and MS acquisition strategies established in D5.1
Construction/coupling of UVPD to the latest Orbitrap instruments (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)An UVPD laser will be coupled to the latest Q-Exactive mass analyzer and/or other Orbitrap instruments
Software modules implemented for MS/MS based analysis of unconven-tional peptide and protein sequences (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Implementation and benchmarking of all algorithms needed for the identification of peptide and proteins measured with the novel and hybrid fragmentation techniques including top and middle down proteomics.
LCMS time-scale compatible top- and middle-down proteomics workflows using hybrid fragmentation methods (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Benchmark the performance in protein identifications of HCD, ETD and EThcD for proteins in the range between 10 and 100 kDa (top-down proteomics)
Top- and middle-down software module (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Further develop the MaxQuant platform in order to analyze and quality control the top and middle down data generated in this project.
Machine learning module for biomarker discovery and classification of clinical samples (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Develop and benchmark a machine learning platform using support vector machines and deep learning networks for making robust decisions on patient treatment based on clinical samples.
LCMS time-scale compatible UV-PD peptide and protein sequencing (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Benchmark the performance in peptide and protein identifications of UVPD versus HCD using a cellular lysate on a Q-Exactive instrument (bottom-up proteomics)
Ethics check (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)All relevant ethical approvals, consent forms and patient information sheets will be uploaded as deliverable 6.12. This will also include an up to date approval from The Central Denmark Region Committees on Health Research Ethics stating the ethical approvals for Aarhus University Hospital are also valid for project MSmed.
Develop and implement high-performance offline high-pH reversed-phase chromatography prior to high-resolution mass spectrometry for parallel analysis of major PTMs without enrichment and apply this to cancer cell lines treated with chemotherapeutic agents.
MaxQuant summer school 2 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)The annual MaxQuant Summer School (host: MPIB, over 160 participants) provides an introduction into the MaxQuant software and application examples. Projeect results will be included into the School’s curriculum.
Data Management Plan (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Describes the strategy for depositing and curating MSmed experimental data in publicly accessible proteomic data bases, the use of proteomic standard formats, and exceptions made as required to protect personal data and intellectual property to be patented
Robust and reproducible sample prepa¬ration protocols including MS instru¬mentation and acquisition strat-egies for large-scale, quantitative PTM analysis from primary tissue samples such as patient biopsy material (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Establish tissue sample preparation protocol based on heat-inactivation of biopsies, efficient protein extraction by ceramic bead milling, in-solution digestion and optimized nanoflow LC-MS/MS acquisition strategies. Benchmark the performance versus established protocols.
MaxQuant summer school (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)The annual MaxQuant Summer School (host: MPIB, over 160 participants) provides an introduction into the MaxQuant software and application examples. Projeect results will be included into the School’s curriculum.
Protocol for hyper-multiplexing (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)Develop labeling protocols and test them for multiplexing and analyzing) more than 10 patient samples at a time (goal is up to 20)
Scientific outreach meeting (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)International scientific outreach meeting on Next Generation Proteomics linked to an annual Progress Meeting of the Netherlands Proteomics Center. Dissemination of project results to the broader community of proteomics researchers in Europe.
Publications
Auteurs:
Kyle L. Fort, Christian N. Cramer, Valery G. Voinov, Yury V. Vasil’ev, Nathan I. Lopez, Joseph S. Beckman, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 17/2, 2018, Page(s) 926-933, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00622
Auteurs:
Alba Cristobal, Fabio Marino, Harm Post, Henk W. P. van den Toorn, Shabaz Mohammed, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 89/6, 2017, Page(s) 3318-3325, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b03756
Auteurs:
Fan Liu, Philip Lössl, Richard Scheltema, Rosa Viner, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 8, 2017, Page(s) 15473, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms15473
Auteurs:
Fan Liu, Philip Lössl, Beverley M. Rabbitts, Robert S. Balaban, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 17/2, 2018, Page(s) 216-232, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.RA117.000470
Auteurs:
Chiara Francavilla, Michela Lupia, Kalliopi Tsafou, Alessandra Villa, Katarzyna Kowalczyk, Rosa Rakownikow Jersie-Christensen, Giovanni Bertalot, Stefano Confalonieri, Søren Brunak, Lars J. Jensen, Ugo Cavallaro, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Cell Reports, Numéro 18/13, 2017, Page(s) 3242-3256, ISSN 2211-1247
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2017.03.015
Auteurs:
Yang Yang, Guanbo Wang, Ting Song, Carlito B. Lebrilla, Albert J. R. Heck
Publié dans:
mAbs, Numéro 9/4, 2017, Page(s) 638-645, ISSN 1942-0870
Éditeur:
Landes Bioscience
DOI:
10.1080/19420862.2017.1290033
Auteurs:
Aneika C. Leney, Karim Rafie, Daan M. F. van Aalten, Albert J. R. Heck
Publié dans:
ACS Chemical Biology, Numéro 12/8, 2017, Page(s) 2078-2084, ISSN 1554-8929
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acschembio.7b00371
Auteurs:
Guanbo Wang, Rob N. de Jong, Ewald T. J. van den Bremer, Paul W. H. I. Parren, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 89/9, 2017, Page(s) 4793-4797, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b05129
Auteurs:
Liana Tsiatsiani, Piero Giansanti, Richard A. Scheltema, Henk van den Toorn, Christopher M. Overall, A.F. Maarten Altelaar, Albert J.R. Heck
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 16/2, 2017, Page(s) 852-861, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.6b00825
Auteurs:
Dorte B. Bekker-Jensen, Christian D. Kelstrup, Tanveer S. Batth, Sara C. Larsen, Christa Haldrup, Jesper B. Bramsen, Karina D. Sørensen, Søren Høyer, Torben F. Ørntoft, Claus L. Andersen, Michael L. Nielsen, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Cell Systems, Numéro 4/6, 2017, Page(s) 587-599.e4, ISSN 2211-1247
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2017.05.009
Auteurs:
Harm Post, Renske Penning, Martin A. Fitzpatrick, Luc B. Garrigues, W. Wu, Harold D. MacGillavry, Casper C. Hoogenraad, Albert J. R. Heck, A. F. Maarten Altelaar
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 16/2, 2017, Page(s) 728-737, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.6b00753
Auteurs:
Vojtech Franc, Yang Yang, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 89/6, 2017, Page(s) 3483-3491, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b04527
Auteurs:
Louise von Stechow, Jesper V. Olsen
Publié dans:
PROTEOMICS, Numéro 17/3-4, 2017, Page(s) 1600018, ISSN 1615-9853
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.201600018
Auteurs:
Adán Alpízar, Fabio Marino, Antonio Ramos-Fernández, Manuel Lombardía, Anita Jeko, Florencio Pazos, Alberto Paradela, César Santiago, Albert J. R. Heck, Miguel Marcilla
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 16/2, 2017, Page(s) 181-193, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.M116.063800
Auteurs:
Stephanie Munk, Jón Otti Sigurðsson, Zhenyu Xiao, Tanveer Singh Batth, Giulia Franciosa, Louise von Stechow, Andres Joaquin Lopez-Contreras, Alfred Cornelis Otto Vertegaal, Jesper Velgaard Olsen
Publié dans:
Cell Reports, Numéro 21/2, 2017, Page(s) 546-558, ISSN 2211-1247
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2017.09.059
Auteurs:
Christian D. Kelstrup, Dorte B. Bekker-Jensen, Tabiwang N. Arrey, Alexander Hogrebe, Alexander Harder, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 17/1, 2017, Page(s) 727-738, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00602
Auteurs:
Tanveer S. Batth, Moreno Papetti, Anamarija Pfeiffer, Maxim A.X. Tollenaere, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Cell Reports, Numéro 22/10, 2018, Page(s) 2784-2796, ISSN 2211-1247
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2018.02.038
Auteurs:
Alexander Hogrebe, Louise von Stechow, Dorte B. Bekker-Jensen, Brian T. Weinert, Christian D. Kelstrup, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, Page(s) 1045, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-03309-6
Auteurs:
Sem Tamara, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck, Aneika C. Leney
Publié dans:
Angewandte Chemie International Edition, Numéro 56/44, 2017, Page(s) 13641-13644, ISSN 1433-7851
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/anie.201706749
Auteurs:
Michiel van de Waterbeemd, Kyle L Fort, Dmitriy Boll, Maria Reinhardt-Szyba, Andrew Routh, Alexander Makarov, Albert J R Heck
Publié dans:
Nature Methods, Numéro 14/3, 2017, Page(s) 283-286, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.4147
Auteurs:
Yang Yang, Vojtech Franc, Albert J.R. Heck
Publié dans:
Trends in Biotechnology, Numéro 35/7, 2017, Page(s) 598-609, ISSN 0167-7799
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.tibtech.2017.04.010
Auteurs:
Kyle L. Fort, Michiel van de Waterbeemd, Dmitriy Boll, Maria Reinhardt-Szyba, Mikhail E. Belov, Eita Sasaki, Reinhard Zschoche, Donald Hilvert, Alexander A. Makarov, Albert J. R. Heck
Publié dans:
The Analyst, Numéro 143/1, 2018, Page(s) 100-105, ISSN 0003-2654
Éditeur:
Royal Society of Chemistry
DOI:
10.1039/c7an01629h
Auteurs:
Marshall Bern, Tomislav Caval, Yong J. Kil, Wilfred Tang, Christopher Becker, Eric Carlson, Doron Kletter, K. Ilker Sen, Nicolas Galy, Dominique Hagemans, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 17/3, 2018, Page(s) 1216-1226, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00839
Auteurs:
James D. Sanders, Dmitry Grinfeld, Konstantin Aizikov, Alexander Makarov, Dustin D. Holden, Jennifer S. Brodbelt
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 90/9, 2018, Page(s) 5896-5902, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b00724
Auteurs:
Dirk Nolting, Robert Malek, Alexander Makarov
Publié dans:
Mass Spectrometry Reviews, 2017, ISSN 0277-7037
Éditeur:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/mas.21549
Auteurs:
Sebastian Virreira Winter, Florian Meier, Christoph Wichmann, Juergen Cox, Matthias Mann, Felix Meissner
Publié dans:
Nature Methods, Numéro 15, 2018, Page(s) 527–530, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0037-8
Auteurs:
Florian Meier, Philipp E. Geyer, Sebastian Virreira Winter, Juergen Cox, Matthias Mann
Publié dans:
Nature Methods, Numéro 15/6, 2018, Page(s) 440-448, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0003-5
Auteurs:
Pavel Sinitcyn, Shivani Tiwary, Jan Rudolph, Petra Gutenbrunner, Christoph Wichmann, Şule Yılmaz, Hamid Hamzeiy, Favio Salinas, Jürgen Cox
Publié dans:
Nature Methods, Numéro 15/6, 2018, Page(s) 401-401, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0018-y
Auteurs:
Hamid Hamzeiy, Jürgen Cox
Publié dans:
Current Opinion in Biotechnology, Numéro 43, 2017, Page(s) 141-146, ISSN 0958-1669
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.copbio.2016.11.014
Auteurs:
Jan P. Gerlach, Ingrid Jordens, Daniele V. F. Tauriello, Ineke van ‘t Land-Kuper, Jeroen M. Bugter, Ivar Noordstra, Johanneke van der Kooij, Teck Y. Low, Felipe X. Pimentel-Muiños, Despina Xanthakis, Nicola Fenderico, Catherine Rabouille, Albert J. R. Heck, David A. Egan, Madelon M. Maurice
Publié dans:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 115/17, 2018, Page(s) E3996-E4005, ISSN 0027-8424
Éditeur:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.1721321115
Auteurs:
Pavel Sinitcyn, Jan Daniel Rudolph, Jürgen Cox
Publié dans:
Annual Review of Biomedical Data Science, Numéro 1/1, 2018, Page(s) 207-234, ISSN 2574-3414
Éditeur:
Annual Reviews
DOI:
10.1146/annurev-biodatasci-080917-013516
Auteurs:
Vojtech Franc, Jing Zhu, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, Numéro 29/6, 2018, Page(s) 1099-1110, ISSN 1044-0305
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1007/s13361-018-1901-6
Auteurs:
Michiel van de Waterbeemd, Sem Tamara, Kyle L. Fort, Eugen Damoc, Vojtech Franc, Philipp Bieri, Martin Itten, Alexander Makarov, Nenad Ban, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-04853-x
Auteurs:
Tomislav Čaval, Weihua Tian, Zhang Yang, Henrik Clausen, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-05536-3
Auteurs:
Philip Lössl, Andrea M. Brunner, Fan Liu, Aneika C. Leney, Masami Yamashita, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Publié dans:
ACS Central Science, Numéro 2/7, 2016, Page(s) 445-455, ISSN 2374-7943
Éditeur:
ACS Publications
DOI:
10.1021/acscentsci.6b00053
Auteurs:
Anna Secher, Christian D. Kelstrup, Kilian W. Conde-Frieboes, Charles Pyke, Kirsten Raun, Birgitte S. Wulff, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 7, 2016, Page(s) 11436, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms11436
Auteurs:
Kyle L. Fort, Andrey Dyachenko, Clement M. Potel, Eleonora Corradini, Fabio Marino, Arjan Barendregt, Alexander A. Makarov, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 88/4, 2016, Page(s) 2303-2310, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.5b04162
Auteurs:
Yu-Hsien Lin, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 17/8, 2018, Page(s) 2861-2869, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00318
Auteurs:
Magnus E. Jakobsson, Jędrzej M. Małecki, Levon Halabelian, Benedikt S. Nilges, Rita Pinto, Srikanth Kudithipudi, Stephanie Munk, Erna Davydova, Fawzi R. Zuhairi, Cheryl H. Arrowsmith, Albert Jeltsch, Sebastian A. Leidel, Jesper V. Olsen, Pål Ø. Falnes
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, Page(s) 3411, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-05646-y
Auteurs:
Ashley L. Comes, Sergi Papiol, Thorsten Mueller, Philipp E. Geyer, Matthias Mann, Thomas G. Schulze
Publié dans:
Translational Psychiatry, Numéro 8/1, 2018, Page(s) 160, ISSN 2158-3188
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41398-018-0219-2
Auteurs:
Jennie R. Lill, Peter A. van Veelen, Stefan Tenzer, Arie Admon, Etienne Caron, Joshua E. Elias, Albert J.R. Heck, Miguel Marcilla, Fabio Marino, Markus Müller, Bjoern Peters, Anthony Purcell, Alessandro Sette, Theo Sturm, Nicola Ternette, Juan Antonio Vizcaíno, Michal Bassani-Sternberg
Publié dans:
PROTEOMICS, Numéro 18/12, 2018, Page(s) 1800110, ISSN 1615-9853
Éditeur:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.201800110
Auteurs:
Sem Tamara, Andrey Dyachenko, Kyle L. Fort, Alexander A. Makarov, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Journal of the American Chemical Society, Numéro 138/34, 2016, Page(s) 10860-10868, ISSN 0002-7863
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/jacs.6b05147
Auteurs:
Stefka Tyanova, Tikira Temu, Pavel Sinitcyn, Arthur Carlson, Marco Y Hein, Tamar Geiger, Matthias Mann, Jürgen Cox
Publié dans:
Nature Methods, Numéro 13/9, 2016, Page(s) 731-740, ISSN 1548-7091
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.3901
Auteurs:
Yang Yang, Fan Liu, Vojtech Franc, Liem Andhyk Halim, Huub Schellekens, Albert J. R. Heck
Publié dans:
Nature Communications, Numéro 7, 2016, Page(s) 13397, ISSN 2041-1723
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms13397
Auteurs:
Philip Lössl, Michiel van de Waterbeemd, Albert JR Heck
Publié dans:
The EMBO Journal, Numéro 35/24, 2016, Page(s) 2634-2657, ISSN 0261-4189
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/embj.201694818
Auteurs:
Chiara Francavilla, Moreno Papetti, Kristoffer T G Rigbolt, Anna-Kathrine Pedersen, Jon O Sigurdsson, Giuseppe Cazzamali, Gopal Karemore, Blagoy Blagoev, Jesper V Olsen
Publié dans:
Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 23/6, 2016, Page(s) 608-618, ISSN 1545-9993
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nsmb.3218
Auteurs:
Dmitry Grinfeld, Konstantin Aizikov, Arne Kreutzmann, Eugen Damoc, Alexander Makarov
Publié dans:
Analytical Chemistry, Numéro 89/2, 2016, Page(s) 1202-1211, ISSN 0003-2700
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b03636
Auteurs:
Nicolai J. Wewer Albrechtsen, Philipp E. Geyer, Sophia Doll, Peter V. Treit, Kirstine N. Bojsen-Møller, Christoffer Martinussen, Nils B. Jørgensen, Signe S. Torekov, Florian Meier, Lili Niu, Alberto Santos, Eva C. Keilhauer, Jens J. Holst, Sten Madsbad, Matthias Mann
Publié dans:
Cell Systems, Numéro 7/6, 2018, Page(s) 601-612.e3, ISSN 2405-4712
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2018.10.012
Auteurs:
Nicolai Bache, Philipp E. Geyer, Dorte B. Bekker-Jensen, Ole Hoerning, Lasse Falkenby, Peter V. Treit, Sophia Doll, Igor Paron, Johannes B. Müller, Florian Meier, Jesper V. Olsen, Ole Vorm, Matthias Mann
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 17/11, 2018, Page(s) 2284-2296, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.TIR118.000853
Auteurs:
Jan Daniel Rudolph, Jürgen Cox
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 18/5, 2019, Page(s) 2052-2064, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00927
Auteurs:
Yasset Perez-Riverol, Attila Csordas, Jingwen Bai, Manuel Bernal-Llinares, Suresh Hewapathirana, Deepti J Kundu, Avinash Inuganti, Johannes Griss, Gerhard Mayer, Martin Eisenacher, Enrique Pérez, Julian Uszkoreit, Julianus Pfeuffer, Timo Sachsenberg, Şule Yılmaz, Shivani Tiwary, Jürgen Cox, Enrique Audain, Mathias Walzer, Andrew F Jarnuczak, Tobias Ternent, Alvis Brazma, Juan Antonio Vizcaíno
Publié dans:
Nucleic Acids Research, Numéro 47/D1, 2018, Page(s) D442-D450, ISSN 0305-1048
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gky1106
Auteurs:
Marta Murgia, Jing Tan, Philipp E. Geyer, Sophia Doll, Matthias Mann, Thomas Klopstock
Publié dans:
Cell Reports, Numéro 29/12, 2019, Page(s) 3825-3834.e4, ISSN 2211-1247
Éditeur:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2019.11.055
Auteurs:
Miao-Hsia Lin, Clement M. Potel, Kamaleddin H. M. E. Tehrani, Albert J. R. Heck, Nathaniel I. Martin, Simone Lemeer
Publié dans:
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Auteurs:
David Y. Chiang, Katherina M. Alsina, Eleonora Corradini, Martin Fitzpatrick, Li Ni, Satadru K. Lahiri, Julia O. Reynolds, Xiaolu Pan, Larry Scott, Albert J.R. Heck, Xander H.T. Wehrens
Publié dans:
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Éditeur:
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DOI:
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Auteurs:
Karli R. Reiding, Albert Bondt, Vojtech Franc, Albert J.R. Heck
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Auteurs:
Clement M. Potel, Domenico Fasci, Albert J.R. Heck
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Clement M. Potel, Miao-Hsia Lin, Albert J. R. Heck, Simone Lemeer
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Clement M Potel, Miao-Hsia Lin, Albert J R Heck, Simone Lemeer
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Auteurs:
Oleg Klykov, Barbara Steigenberger, Sibel Pektaş, Domenico Fasci, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
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Nature Protocols, Numéro 13/12, 2018, Page(s) 2964-2990, ISSN 1754-2189
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Nature Publishing Group
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Auteurs:
Domenico Fasci, Hugo van Ingen, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
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Jean-François Greisch, Sem Tamara, Richard A. Scheltema, Howard W. R. Maxwell, Robert D. Fagerlund, Peter C. Fineran, Stephan Tetter, Donald Hilvert, Albert J. R. Heck
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Springer Verlag
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Clement M. Potel, Simone Lemeer, Albert J. R. Heck
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American Chemical Society
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Auteurs:
Jing Zhu, Luc Garrigues, Henk Van den Toorn, Bernd Stahl, Albert J. R. Heck
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Andrey Dyachenko, Sem Tamara, Albert J. R. Heck
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Tomislav Čaval, Jing Zhu, Weihua Tian, Sanne Remmelzwaal, Zhang Yang, Henrik Clausen, Albert J.R. Heck
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Auteurs:
Sebastiaan C. de Graaf, Oleg Klykov, Henk van den Toorn, Richard A. Scheltema
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Auteurs:
Philipp E Geyer, Eugenia Voytik, Peter V Treit, Sophia Doll, Alisa Kleinhempel, Lili Niu, Johannes B Müller, Marie‐Luise Buchholtz, Jakob M Bader, Daniel Teupser, Lesca M Holdt, Matthias Mann
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DOI:
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Auteurs:
Lili Niu, Philipp E Geyer, Nicolai J Wewer Albrechtsen, Lise L Gluud, Alberto Santos, Sophia Doll, Peter V Treit, Jens J Holst, Filip K Knop, Tina Vilsbøll, Anders Junker, Stephan Sachs, Kerstin Stemmer, Timo D Müller, Matthias H Tschöp, Susanna M Hofmann, Matthias Mann
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DOI:
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Auteurs:
Alicia Lundby, Giulia Franciosa, Kristina B. Emdal, Jan C. Refsgaard, Sebastian P. Gnosa, Dorte B. Bekker-Jensen, Anna Secher, Svetlana R. Maurya, Indranil Paul, Blanca L. Mendez, Christian D. Kelstrup, Chiara Francavilla, Marie Kveiborg, Guillermo Montoya, Lars J. Jensen, Jesper V. Olsen
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Cell, Numéro 179/2, 2019, Page(s) 543-560.e26, ISSN 0092-8674
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DOI:
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Auteurs:
Tanveer S. Batth, Maxim A. X. Tollenaere, Patrick Rüther, Alba Gonzalez-Franquesa, Bhargav S. Prabhakar, Simon Bekker-Jensen, Atul S. Deshmukh, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Molecular & Cellular Proteomics, Numéro 18/5, 2019, Page(s) 1027-1035, ISSN 1535-9476
Éditeur:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir118.001270
Auteurs:
Kristina B. Emdal, Anna-Kathrine Pedersen, Dorte B. Bekker-Jensen, Alicia Lundby, Shana Claeys, Katleen De Preter, Frank Speleman, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Science Signaling, Numéro 11/557, 2018, Page(s) eaap9752, ISSN 1937-9145
Éditeur:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/scisignal.aap9752
Auteurs:
Christian D. Kelstrup, Konstantin Aizikov, Tanveer S. Batth, Arne Kreutzman, Dmitry Grinfeld, Oliver Lange, Daniel Mourad, Alexander A. Makarov, Jesper V. Olsen
Publié dans:
Journal of Proteome Research, Numéro 17/11, 2018, Page(s) 4008-4016, ISSN 1535-3893
Éditeur:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00381
Auteurs:
Vyacheslav Akimov, Inigo Barrio-Hernandez, Sten V. F. Hansen, Philip Hallenborg, Anna-Kathrine Pedersen, Dorte B. Bekker-Jensen, Michele Puglia, Stine D. K. Christensen, Jens T. Vanselow, Mogens M. Nielsen, Irina Kratchmarova, Christian D. Kelstrup, Jesper V. Olsen, Blagoy Blagoev
Publié dans:
Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 25/7, 2018, Page(s) 631-640, ISSN 1545-9993
Éditeur:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41594-018-0084-y
Auteurs:
Miia R. Mäkelä, Ourdia Bouzid, Diogo Robl, Harm Post, Mao Peng, Albert Heck, Maarten Altelaar, Ronald P. de Vries
Publié dans:
New Biotechnology, Numéro 37, 2017, Page(s) 162-171, ISSN 1871-6784
Éditeur:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.nbt.2017.02.002
Auteurs:
Hecht, E.S., Scigelova, M., Eliuk, S. and Makarov, A.
Publié dans:
Encyclopedia of Analytical Chemistry, 2019
Éditeur:
Wiley Online Library
Auteurs:
Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José M. A. Moreira, Matthias Mann
Publié dans:
bioRxiv, 2019
Éditeur:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/779009
Auteurs:
Dorte B. Bekker-Jensen, Ana Martínez del Val, Sophia Steigerwald, Patrick Rüther, Kyle Fort, Tabiwang N. Arrey, Alexander Harder, Alexander Makarov, Jesper V. Olsen
Publié dans:
bioRxiv, 2019
Éditeur:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/860643
Auteurs:
Dorte B. Bekker-Jensen, Oliver M. Bernhardt, Alexander Hogrebe, Ana Martinez del Val, Lynn Verbeke, Tejas Gandhi, Christian D. Kelstrup, Lukas Reiter, Jesper V. Olsen
Publié dans:
bioRxiv, 2019
Éditeur:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/657858
Droits de propriété intellectuelle
Numéro de demande/publication:
19
175643
Date:
2017-06-02
Demandeur(s):
THERMO FISHER SCIENTIFIC (BREMEN) GMBH
Numéro de demande/publication:
17
174330
Date:
2017-06-02
Demandeur(s):
THERMO FISHER SCIENTIFIC (BREMEN) GMBH
Numéro de demande/publication:
25
69639
Date:
1939-09-13
Demandeur(s):
THERMO FISHER SCIENTIFIC (BREMEN) GMBH
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