Objetivo
One of key challenges in current biology is to characterize the genotype to phenotype transition and explain how genomic variation results in specific phenotypes. According to the 'modular biology' paradigm, dynamically regulated multi-protein modules mediate this transition. My project aims at testing this paradigm by applying to a clinically highly relevant case study an integrated workflow of new technologies developed in the host laboratory. In particular, I will focus on a novel ubiquitin ligase complex, linear ubiquitin chain assembly complex (LUBAC), a critical but poorly understood player in several inflammation-related pathways, most notably the canonical NF-κB pathway. Given its key role in the pathogenesis of inflammation, understanding LUBAC will have fundamental biomedical implications. To investigate its structure, function and regulation, I will integrate data generated by mass spectrometry, which is the focus of the Aebersold laboratory, and cryo-electron microscopy (cryo-EM), which is the main expertise I acquired during my PhD. First, I will use quantitative affinity-purification coupled to mass spectrometry (AP-SWATH) to identify the dynamic interactome and the post-translation modifications (PTMs) of LUBAC. I will then define the structure of the complex by combining available atomic models of known LUBAC components, cryo-EM and cross-linking coupled to mass spectrometry (XL-MS). Finally, I will study clinical mutants and map the repercussions of genetic variation at the level of the complex organization, its interactome and of the global proteomic landscape. By these means, I will give a systemic and mechanistic account of the genotype to phenotype transition in clinically relevant scenarios. The output of the project, in line with the Work Programme, will be the production of new knowledge of fundamental biological and medical relevance and the development and validation of enabling technologies at the forefront of molecular biology research.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2015
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
8092 Zuerich
Suiza
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.