Objectif
The aim of this study is to analyze the comprehensive proteome associated with viral DNA. This systems biology approach that will combine functional proteomics and genomics has the name Viral Genome Associated Proteome (VGAP). It is based on a modification and refinement of the Hybridization Capture of Chromatin Associated Proteins for Proteomics (HyCCAPP) technology. All proteins associated with viral DNA, initially using Herpes simplex virus for proof of concept, will be cross-linked by paraformaldehyde treatment, the viral DNA will be selectively precipitated, and all proteins associated with the viral genome will be analyzed by mass spectrometry. The results will reveal all cellular and viral proteins that physically interact with the viral genome at a certain time and that are involved among others in regulation of viral genome structure, viral gene expression, DNA repair and cellular intrinsic immunity.
The development of VGAP, a new method for the specific analysis of the viral genome-associated proteome will provide a new tool for the research of DNA viruses. In theory VGAP should be applicable to all DNA viruses, and we think it will be possible to analyze proteins associated with the DNA of all DNA viruses, so the entire field of virology should profit from the establishment of viral HyCCAPP. DNA viruses include important human pathogens like herpesviruses, human papillomaviruses and adenoviruses. A plethora of novel viral DNA-protein interactions will be discovered that will spark new research projects and can serve as new targets for antiviral therapy and vaccination strategies. Although beyond the scope of this proposal, so far unknown cellular proteins that are needed for efficient viral replication can be used for screening of small molecule libraries and novel small molecule inhibitors identified for antiviral therapy.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie dystrophie musculaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome génome viral
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ARN grippe
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ADN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antiviral
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2015
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
91054 Erlangen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.