Objectif
Histone proteins provide a dynamic packaging system for the eukaryotic genome. Chromatin integrates a multitude of signals to control gene expression, only some of which have the propensity to be maintained through replication and cell division. For our understanding of cellular memory and epigenetic inheritance we need to know what features characterize a stable, heritable chromatin state throughout the cell cycle. State-of-the-art methods such as ChIP-Seq provide population-based snapshots of the epigenomic landscape but little information on the stability and relative importance of each studied feature or modification. This project pioneers a rapid, sensitive and selective protein labeling method (termed RAPID) for capturing genome-wide chromatin dynamics resolved over a period of time ranging from minutes to days. RAPID introduces a flexible time dimension in the form of pulse or pulse-chase experiments for studying genome-wide occupancy of a protein of interest by next-gen sequencing. It can also be coupled to other readouts such as mass spectrometry or microscopy. RAPID is uniquely suited for studying cell cycle-linked processes, by defining when and where stable ‘marks’ are set in chromatin. I will employ mouse embryonic stem cell (mESC) as a model system for pluripotency and lineage specification. RAPID will define fundamental rules for inheritance of histone and other chromatin-associated proteins and how they are modulated by the fast cell cycle of pluripotent cells. Using RAPID in combination with other state-of-the art genetics and epigenomics, I will collect multi-dimensional descriptions of the dynamic evolution and propagation of functionally relevant chromatin states, such as interstitial heterochromatin and developmentally regulated Polycomb domains.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome génome eucaryote
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2016-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
171 77 STOCKHOLM
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.