Chromatin dynamics resolved by rapid protein labeling and bioorthogonal capture

Informations projet

RAPID

N° de convention de subvention: 715024

DOI

10.3030/715024

Projet clôturé

Date de signature de la CE 7 Decembre 2016

Date de début 1 Janvier 2017

Date de fin 30 Juin 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 846 360,00

Contribution de l’UE

€ 1 846 360,00

Coordonné par

KAROLINSKA INSTITUTET
Sweden

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Publications

Peer reviewed articles (8)

Distinct transcription kinetics of pluripotent cell states

Auteurs: Rui Shao; Banushree Kumar; Katja Lidschreiber; Michael Lidschreiber; Patrick Cramer; Simon J Elsässer
Publié dans: Molecular Systems Biology, Numéro 2, 2022, ISSN 1744-4292
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202110407

TET1 regulates gene expression and repression of endogenous retroviruses independent of DNA demethylation

Auteurs: Paul Stolz; Angelo Salazar Mantero; Andrey Tvardovskiy; Enes Ugur; Lucas E Wange; Christopher B Mulholland; Yuying Cheng; Michael Wierer; Wolfgang Enard; Robert Schneider; Till Bartke; Heinrich Leonhardt; Simon J Elsässer; Sebastian Bultmann
Publié dans: Nucleic Acid Research, Numéro 1, 2022, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac642

Evolution of epigenetic chromatin states

Auteurs: Philip Yuk Kwong Yung, Simon J Elsässer
Publié dans: Current Opinion in Chemical Biology, Numéro 41, 2017, Page(s) 36-42, ISSN 1367-5931
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2017.10.001

Polycomb repressive complex 2 shields naïve human pluripotent cells from trophectoderm differentiation

Auteurs: Banushree Kumar, Carmen Navarro, Nerges Winblad, John P. Schell, Cheng Zhao, Jere Weltner, Laura Baqué-Vidal, Angelo Salazar Mantero, Sophie Petropoulos, Fredrik Lanner & Simon J. Elsässer
Publié dans: Nature Cell Biology, 2022, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-022-00916-w

Engineered human induced pluripotent cells enable genetic code expansion in brain organoids

Auteurs: Lea S. van Husen, Anna-Maria Katasori, Birthe Meineke, Lars O. Tjernberg, Sophia Schedin-Weiss, Simon J Elsässer
Publié dans: ChemBioChem, 2021, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202100399

Methanomethylophilus alvus Mx1201 Provides Basis for Mutual Orthogonal Pyrrolysyl tRNA/Aminoacyl-tRNA Synthetase Pairs in Mammalian Cells

Auteurs: Birthe Meineke, Johannes Heimgärtner, Lorenzo Lafranchi, Simon J. Elsässer
Publié dans: ACS Chemical Biology, Numéro 13/11, 2018, Page(s) 3087-3096, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.8b00571

An embryonic stem cell-specific heterochromatin state promotes core histone exchange in the absence of DNA accessibility

Auteurs: Carmen Navarro, Jing Lyu, Anna-Maria Katsori, Rozina Caridha, Simon J. Elsässer
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18863-1

Quantitative Multiplexed ChIP Reveals Global Alterations that Shape Promoter Bivalency in Ground State Embryonic Stem Cells

Auteurs: Banushree Kumar, Simon J. Elsässer
Publié dans: Cell Reports, Numéro 28/12, 2019, Page(s) 3274-3284.e5, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.08.046

Other (1)

Polycomb Repressive Complex 2 shields naïve human pluripotent cells from trophectoderm differentiation

Auteurs: Banushree Kumar, Carmen Navarro, Nerges Winblad, John P Schell, Cheng Zhao, Fredrik Lanner, Simon J Elsässer
Publié dans: bioRxiv preprint, 2021
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.08.21.457215

Book chapters (1)

Generation of Stable Amber Suppression Cell Lines

Auteurs: Simon J. Elsässer
Publié dans: Noncanonical Amino Acids, Numéro 1728, 2018, Page(s) 237-245, ISBN 978-1-4939-7573-0
Éditeur: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-7574-7_15