The role of three-dimensional genome architecture in antigenic variation

Informations projet

3D_Tryps

N° de convention de subvention: 715466

DOI

10.3030/715466

Projet clôturé

Date de signature de la CE 10 Février 2017

Date de début 1 Avril 2017

Date de fin 31 Mars 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 498 175,00

Contribution de l’UE

€ 1 498 175,00

Coordonné par

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Other (3)

Cell-to-Cell Heterogeneity in Trypanosomes

Auteurs: Vanessa Luzak, Lara López-Escobar, T. Nicolai Siegel, Luisa M. Figueiredo
Publié dans: Annual Review of Microbiology, Numéro 75/1, 2021, Page(s) 107-128, ISSN 0066-4227
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-micro-040821-012953

A phased genome assembly for allele-specific analysis in Trypanosoma brucei

Auteurs: RO Cosentino, BG Brink, TN Siegel
Publié dans: BioRxiv, 2021
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.04.13.439624

Antigenic variation by switching inter-chromosomal interactions with an RNA splicing locus in trypanosomes

Auteurs: Faria J, Luzak V, Müller LS, Brink BG, Hutchinson S, Glover L, Horn D, Siegel TN
Publié dans: BioRxiv, 2020
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2020.01.27.921452

Peer reviewed articles (6)

Efficient and specific oligo-based depletion of rRNA

Auteurs: Amelie J. Kraus; Amelie J. Kraus; Benedikt G. Brink; T. Nicolai Siegel; T. Nicolai Siegel
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 2, 2019, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-48692-2

Allele-specific assembly of a eukaryotic genome corrects apparent frameshifts and reveals a lack of nonsense-mediated mRNA decay

Auteurs: Raúl O Cosentino, Benedikt G Brink, T Nicolai Siegel
Publié dans: NAR Genomics and Bioinformatics, Numéro 3/3, 2021, ISSN 2631-9268
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqab082

Genome organization and DNA accessibility control antigenic variation in trypanosomes

Auteurs: Laura S. M. Müller, Raúl O. Cosentino, Konrad U. Förstner, Julien Guizetti, Carolin Wedel, Noam Kaplan, Christian J. Janzen, Panagiota Arampatzi, Jörg Vogel, Sascha Steinbiss, Thomas D. Otto, Antoine-Emmanuel Saliba, Robert P. Sebra, T. Nicolai Siegel
Publié dans: Nature, Numéro 563/7729, 2018, Page(s) 121-125, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0619-8

Exploiting CRISPR–Cas9 technology to investigate individual histone modifications

Auteurs: Juan-José Vasquez, Carolin Wedel, Raul O Cosentino, T Nicolai Siegel
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 46/18, 2018, Page(s) e106-e106, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky517

Distinct roles for H4 and H2A.Z acetylation in RNA transcription in African trypanosomes

Auteurs: Amelie J. Kraus, Jens T. Vanselow, Stephanie Lamer, Benedikt G. Brink, Andreas Schlosser, T. Nicolai Siegel
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-15274-0

Spatial integration of transcription and splicing in a dedicated compartment sustains monogenic antigen expression in African trypanosomes

Auteurs: Joana Faria, Vanessa Luzak, Laura S. M. Müller, Benedikt G. Brink, Sebastian Hutchinson, Lucy Glover, David Horn, T. Nicolai Siegel
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 6/3, 2021, Page(s) 289-300, ISSN 2058-5276
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-020-00833-4