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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Illuminating GENome Organization through integrated MIcroscopy and Sequencing

Objectif

In human cells, two meters of DNA sequence are compressed into a nucleus whose linear size is five orders of magnitude smaller. Deciphering how this amazing structural organization is achieved and how DNA functions can ensue in the environment of a cell’s nucleus represent central questions for contemporary biology.

Here, I embrace this challenge by establishing a comprehensive framework of microscopy and sequencing technologies coupled with advanced analytical approaches, aimed at addressing three fundamental highly-interconnected questions: 1) What are the design principles that govern DNA compaction? 2) How does genome structure vary between different cell types as well as among cells of the same type? 3) What is the link between genome structure and function? In preliminary experiments, we have devised a powerful method for Genomic loci Positioning by Sequencing (GPSeq) in fixed cells with optimally preserved nuclear morphology. In parallel, we are developing high-end microscopy tools for simultaneous localization of dozens of genomic locations at high resolution in thousands of single cells.

We will obtain first-ever genome-wide maps of radial positioning of DNA loci in the nucleus, and combine them with available DNA contact probability maps in order to build 3D models of the human genome structure in different cell types. Using microscopy, we will visualize chromosomal shapes at unprecedented resolution, and use these rich datasets to discover general DNA folding principles. Finally, by combining high-resolution chromosome visualization with gene expression profiling in single cells, we will explore the link between DNA structure and function. Our study shall illuminate the design principles that dictate how genetic information is packed and read in the human nucleus, while providing a comprehensive repertoire of tools for studying genome organization.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-STG - Starting Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2016-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

KAROLINSKA INSTITUTET
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 499 808,00
Adresse
NOBELS VAG 5
171 77 STOCKHOLM
Suède

Voir sur la carte

Région
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 499 808,00

Bénéficiaires (1)

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