Ziel
DNA-protein cross-links (DPCs) are common DNA lesions caused by endogenous, environmental, and chemotherapeutic agents. Cells are susceptible to these lesions during S phase, as DPCs impede replication fork progression and are likely to induce genomic instability, a cause of cancer and aging. Despite its relevance to human health, the repair of DPCs is poorly understood. Research on DPC repair has mainly involved testing cellular responses to compounds such as formaldehyde, but these agents induce a wide variety of DNA lesions, and conflicting results have been reported. To overcome these obstacles, I have developed the first in vitro system that recapitulates replication-coupled DPC repair. In this system, a plasmid containing a site-specific DPC is replicated in Xenopus egg extracts. Using this approach, I demonstrated that DPC repair requires DNA replication. When a replication fork encounters a DPC, the DPC is degraded into a peptide-adduct, which allows replication bypass by translesion DNA synthesis. Importantly, these experiments identified a novel proteolytic pathway whose activity is regulated by replication.
This in vitro system now provides a powerful means to identify and characterize the different factors that participate in S phase DPC repair. I speculate that for DPC processing to occur, the protein-adduct must first be detected, then marked for degradation and ultimately degraded. Using a series of complementary strategies, which will take advantage of the in vitro system combined with proteome and genome wide approaches, I seek to uncover the different players that participate in each of these events. This project will enable a detailed mechanistic outlook of a complex multi-step reaction that has not been feasible to achieve using existing methodologies. It will also improve our understanding of how DPCs impact genomic stability and the consequences of not repairing these lesions for human health.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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ERC-STG - Starting Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2016-STG
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1165 KOBENHAVN
Dänemark
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