Herpesvirus Effectors of RNA synthesis, Processing, Export and Stability

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Concatemeric Broccoli reduces mRNA stability and induces aggregates

Auteurs: Marco R. Rink, Marisa A. P. Baptista, Felix J. Flomm, Thomas Hennig, Adam W. Whisnant, Natalia Wolf, Jürgen Seibel, Lars Dölken, Jens B. Bosse
Publié dans: PLoS One, Numéro 16(8):e0244166, 2021, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0244166

Mechanism and consequences of herpes simplex virus 1-mediated regulation of host mRNA alternative polyadenylation

Auteurs: Xiuye Wang, Liang Liu, Adam W Whisnant, Thomas Hennig, Lara Djakovic, Nabila Haque, Cindy Bach, Rozanne M Sandri-Goldin, Florian Erhard, Caroline C Friedel, Lars Dölken, Yongsheng Shi
Publié dans: PLoS Genetics, Numéro 8;17(3):e1009263, 2021, ISSN 1553-7390
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009263

Selective inhibition of miRNA processing by a herpesvirus-encoded miRNA

Auteurs: Thomas Hennig, Archana B. Prusty, Benedikt B. Kaufer, Adam W. Whisnant, Manivel Lodha, Antje Enders, Julius Thomas, Francesca Kasimir, Arnhild Grothey, Teresa Klein, Stefanie Herb, Christopher Jürges, Markus Sauer, Utz Fischer, Thomas Rudel, Gunter Meister, Florian Erhard, Lars Dölken & Bhupesh K. Prusty
Publié dans: Nature, Numéro 605 (2022), 2022, Page(s) 539-544, ISSN 1476-4687
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04667-4

HSV-1-induced disruption of transcription termination resembles a cellular stress response but selectively increases chromatin accessibility downstream of genes

Auteurs: Thomas Hennig, Marco Michalski, Andrzej J. Rutkowski, Lara Djakovic, Adam W. Whisnant, Marie-Sophie Friedl, Bhaskar Anand Jha, Marisa A. P. Baptista, Anne L’Hernault, Florian Erhard, Lars Dölken, Caroline C. Friedel
Publié dans: PLOS Pathogens, Numéro 14/3, 2018, Page(s) e1006954, ISSN 1553-7374
Éditeur: PLoS Pathogens
DOI: 10.1371/journal.ppat.1006954

Dissecting newly transcribed and old RNA using GRAND-SLAM

Auteurs: Christopher Jürges, Lars Dölken, Florian Erhard
Publié dans: Bioinformatics, Numéro 34/13, 2018, Page(s) i218-i226, ISSN 1367-4803
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/bty256

Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection

Auteurs: Emanuel Wyler, Jennifer Menegatti, Vedran Franke, Christine Kocks, Anastasiya Boltengagen, Thomas Hennig, Kathrin Theil, Andrzej Rutkowski, Carmelo Ferrai, Laura Baer, Lisa Kermas, Caroline Friedel, Nikolaus Rajewsky, Altuna Akalin, Lars Dölken, Friedrich Grässer, Markus Landthaler
Publié dans: Genome Biology, Numéro 18/1, 2017, ISSN 1474-760X
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-017-1329-5

Improved Ribo-seq enables identification of cryptic translation events

Auteurs: Florian Erhard, Anne Halenius, Cosima Zimmermann, Anne L'Hernault, Daniel J Kowalewski, Michael P Weekes, Stefan Stevanovic, Ralf Zimmer, Lars Dölken
Publié dans: Nature Methods, Numéro 15/5, 2018, Page(s) 363-366, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4631

RNA dynamics revealed by metabolic RNA labeling and biochemical nucleoside conversions

Auteurs: Marisa A P Baptista, Lars Dölken
Publié dans: Nature Methods, Numéro 15/3, 2018, Page(s) 171-172, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4608

P-TEFb Activation by RBM7 Shapes a Pro-survival Transcriptional Response to Genotoxic Stress

Auteurs: Andrii Bugai, Alexandre J.C. Quaresma, Caroline C. Friedel, Tina Lenasi, Robert Düster, Christopher R. Sibley, Koh Fujinaga, Petra Kukanja, Thomas Hennig, Melanie Blasius, Matthias Geyer, Jernej Ule, Lars Dölken, Matjaž Barborič
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 74/2, 2019, Page(s) 254-267.e10, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.01.033

scSLAM-seq reveals core features of transcription dynamics in single cells

Auteurs: Florian Erhard, Marisa A. P. Baptista, Tobias Krammer, Thomas Hennig, Marius Lange, Panagiota Arampatzi, Christopher S. Jürges, Fabian J. Theis, Antoine-Emmanuel Saliba, Lars Dölken
Publié dans: Nature, Numéro 571/7765, 2019, Page(s) 419-423, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1369-y

Integrative functional genomics decodes herpes simplex virus 1

Auteurs: Adam W. Whisnant, Christopher S. Jürges, Thomas Hennig, Emanuel Wyler, Bhupesh Prusty, Andrzej J. Rutkowski, Anne L’hernault, Lara Djakovic, Margarete Göbel, Kristina Döring, Jennifer Menegatti, Robin Antrobus, Nicholas J. Matheson, Florian W. H. Künzig, Guido Mastrobuoni, Chris Bielow, Stefan Kempa, Chunguang Liang, Thomas Dandekar, Ralf Zimmer, Markus Landthaler, Friedrich Grässer, Paul J
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-15992-5

Herpes simplex virus blocks host transcription termination via the bimodal activities of ICP27

Auteurs: Xiuye Wang, Thomas Hennig, Adam W. Whisnant, Florian Erhard, Bhupesh K. Prusty, Caroline C. Friedel, Elmira Forouzmand, William Hu, Luke Erber, Yue Chen, Rozanne M. Sandri-Goldin, Lars Dölken, Yongsheng Shi
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-14109-x

Targeted protein degradation reveals a direct role of SPT6 in RNAPII elongation and termination

Auteurs: Ashwin Narain, Pranjali Bhandare,Bikash Adhikari, Simone Backes, Martin Eilers, Lars Dölken, Andreas Schlosser, Florian Erhard, Apoorva Baluapuri, Elmar Wolf
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 81(15) (2021), 2021, Page(s) 3110-3127, ISSN 1097-4164
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.06.016

A Review of the Multipronged Attack of Herpes Simplex Virus 1 on the Host Transcriptional Machinery.

Auteurs: Thomas Hennig; Lara Djakovic; Lars Dölken; Adam W. Whisnant
Publié dans: Viruses, Numéro 13(9):1836, 2021, ISSN 1476-4687
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/v13091836

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