Herpesvirus Effectors of RNA synthesis, Processing, Export and Stability

Projektinformationen

HERPES

ID Finanzhilfevereinbarung: 721016

DOI

10.3030/721016

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 5 April 2017

Startdatum 1 Mai 2017

Enddatum 30 April 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 994 375,00

EU-Beitrag

€ 1 994 375,00

Koordiniert durch

JULIUS-MAXIMILIANS-UNIVERSITAT WURZBURG
Germany

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (13)

Concatemeric Broccoli reduces mRNA stability and induces aggregates

Autoren: Marco R. Rink, Marisa A. P. Baptista, Felix J. Flomm, Thomas Hennig, Adam W. Whisnant, Natalia Wolf, Jürgen Seibel, Lars Dölken, Jens B. Bosse
Veröffentlicht in: PLoS One, Ausgabe 16(8):e0244166, 2021, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0244166

Mechanism and consequences of herpes simplex virus 1-mediated regulation of host mRNA alternative polyadenylation

Autoren: Xiuye Wang, Liang Liu, Adam W Whisnant, Thomas Hennig, Lara Djakovic, Nabila Haque, Cindy Bach, Rozanne M Sandri-Goldin, Florian Erhard, Caroline C Friedel, Lars Dölken, Yongsheng Shi
Veröffentlicht in: PLoS Genetics, Ausgabe 8;17(3):e1009263, 2021, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009263

Selective inhibition of miRNA processing by a herpesvirus-encoded miRNA

Autoren: Thomas Hennig, Archana B. Prusty, Benedikt B. Kaufer, Adam W. Whisnant, Manivel Lodha, Antje Enders, Julius Thomas, Francesca Kasimir, Arnhild Grothey, Teresa Klein, Stefanie Herb, Christopher Jürges, Markus Sauer, Utz Fischer, Thomas Rudel, Gunter Meister, Florian Erhard, Lars Dölken & Bhupesh K. Prusty
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 605 (2022), 2022, Seite(n) 539-544, ISSN 1476-4687
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04667-4

HSV-1-induced disruption of transcription termination resembles a cellular stress response but selectively increases chromatin accessibility downstream of genes

Autoren: Thomas Hennig, Marco Michalski, Andrzej J. Rutkowski, Lara Djakovic, Adam W. Whisnant, Marie-Sophie Friedl, Bhaskar Anand Jha, Marisa A. P. Baptista, Anne L’Hernault, Florian Erhard, Lars Dölken, Caroline C. Friedel
Veröffentlicht in: PLOS Pathogens, Ausgabe 14/3, 2018, Seite(n) e1006954, ISSN 1553-7374
Herausgeber: PLoS Pathogens
DOI: 10.1371/journal.ppat.1006954

Dissecting newly transcribed and old RNA using GRAND-SLAM

Autoren: Christopher Jürges, Lars Dölken, Florian Erhard
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 34/13, 2018, Seite(n) i218-i226, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/bty256

Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection

Autoren: Emanuel Wyler, Jennifer Menegatti, Vedran Franke, Christine Kocks, Anastasiya Boltengagen, Thomas Hennig, Kathrin Theil, Andrzej Rutkowski, Carmelo Ferrai, Laura Baer, Lisa Kermas, Caroline Friedel, Nikolaus Rajewsky, Altuna Akalin, Lars Dölken, Friedrich Grässer, Markus Landthaler
Veröffentlicht in: Genome Biology, Ausgabe 18/1, 2017, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-017-1329-5

Improved Ribo-seq enables identification of cryptic translation events

Autoren: Florian Erhard, Anne Halenius, Cosima Zimmermann, Anne L'Hernault, Daniel J Kowalewski, Michael P Weekes, Stefan Stevanovic, Ralf Zimmer, Lars Dölken
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 15/5, 2018, Seite(n) 363-366, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4631

RNA dynamics revealed by metabolic RNA labeling and biochemical nucleoside conversions

Autoren: Marisa A P Baptista, Lars Dölken
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 15/3, 2018, Seite(n) 171-172, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.4608

P-TEFb Activation by RBM7 Shapes a Pro-survival Transcriptional Response to Genotoxic Stress

Autoren: Andrii Bugai, Alexandre J.C. Quaresma, Caroline C. Friedel, Tina Lenasi, Robert Düster, Christopher R. Sibley, Koh Fujinaga, Petra Kukanja, Thomas Hennig, Melanie Blasius, Matthias Geyer, Jernej Ule, Lars Dölken, Matjaž Barborič
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 74/2, 2019, Seite(n) 254-267.e10, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.01.033

scSLAM-seq reveals core features of transcription dynamics in single cells

Autoren: Florian Erhard, Marisa A. P. Baptista, Tobias Krammer, Thomas Hennig, Marius Lange, Panagiota Arampatzi, Christopher S. Jürges, Fabian J. Theis, Antoine-Emmanuel Saliba, Lars Dölken
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 571/7765, 2019, Seite(n) 419-423, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1369-y

Integrative functional genomics decodes herpes simplex virus 1

Autoren: Adam W. Whisnant, Christopher S. Jürges, Thomas Hennig, Emanuel Wyler, Bhupesh Prusty, Andrzej J. Rutkowski, Anne L’hernault, Lara Djakovic, Margarete Göbel, Kristina Döring, Jennifer Menegatti, Robin Antrobus, Nicholas J. Matheson, Florian W. H. Künzig, Guido Mastrobuoni, Chris Bielow, Stefan Kempa, Chunguang Liang, Thomas Dandekar, Ralf Zimmer, Markus Landthaler, Friedrich Grässer, Paul J
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-15992-5

Herpes simplex virus blocks host transcription termination via the bimodal activities of ICP27

Autoren: Xiuye Wang, Thomas Hennig, Adam W. Whisnant, Florian Erhard, Bhupesh K. Prusty, Caroline C. Friedel, Elmira Forouzmand, William Hu, Luke Erber, Yue Chen, Rozanne M. Sandri-Goldin, Lars Dölken, Yongsheng Shi
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-14109-x

Targeted protein degradation reveals a direct role of SPT6 in RNAPII elongation and termination

Autoren: Ashwin Narain, Pranjali Bhandare,Bikash Adhikari, Simone Backes, Martin Eilers, Lars Dölken, Andreas Schlosser, Florian Erhard, Apoorva Baluapuri, Elmar Wolf
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 81(15) (2021), 2021, Seite(n) 3110-3127, ISSN 1097-4164
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.06.016

Other (1)

A Review of the Multipronged Attack of Herpes Simplex Virus 1 on the Host Transcriptional Machinery.

Autoren: Thomas Hennig; Lara Djakovic; Lars Dölken; Adam W. Whisnant
Veröffentlicht in: Viruses, Ausgabe 13(9):1836, 2021, ISSN 1476-4687
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/v13091836