Molecular Tools for Nucleic Acid Manipulation for Biological Intervention

Informations projet

MMBio

N° de convention de subvention: 721613

DOI 10.3030/721613

Projet clôturé

Date de signature de la CE 31 Août 2016

Date de début 1 Janvier 2017

Date de fin 31 Août 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total € 3 971 347,92

Contribution de l’UE € 3 971 347,92

Coordonné par

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

Livrables

Documents, reports (1)

Public engagement and dissemination of achievements

month 44: Participation in public open day to disseminate the project outcomes

Other (3)

Summer School

A five day summer school, open to the public, will be organised by beneficiary KI entitled Nucleic Acids in Therapy

Science communication course

(month 8): a Science Communication course that develops their skills in conveying complex scientific ideas to a general audience, and provide the technical skills to prepare videos and podcasts will be provided.

Network Conference

month 44 A twoday conference to showcase the research area and the achievements of the network accessible to the general public This can be a free standing event or part of a relevant conference eg the Annual Meetings of the Oligonucleotide Therapeutics Society or the International Round Table on Nucleosides Nucleotides and Nucleic Acids in Stockholm JuneJuly 2018

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website, ESR webpages and Moodle operational

Publications

Peer reviewed articles (22)

Lipophilic Peptide Dendrimers for Delivery of Splice-Switching Oligonucleotides

Auteurs: Haneen Daralnakhla, Osama Saher, Susanna Zamolo, Safa Bazaz, Jeremy P. Bost, Marc Heitz, Karin E. Lundin, Samir EL Andaloussi, Tamis Darbre, Jean-Louis Reymond, Rula Zain, C. I. Edvard Smith
Publié dans: Pharmaceutics, Numéro 13/1, 2021, Page(s) 116, ISSN 1999-4923
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pharmaceutics13010116

Sequence dependence of Pd(II)-mediated base pairing by palladacyclic nucleobase surrogates

Auteurs: Madhuri Hande, Sajal Maity, Tuomas Lönnberg
Publié dans: Journal of Inorganic Biochemistry, Numéro 222, 2021, Page(s) 111506, ISSN 0162-0134
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2021.111506

Oligonucleotides Targeting DNA Repeats Downregulate Huntingtin Gene Expression in Huntington's Patient-Derived Neural Model System

Auteurs: Tea Umek, Thomas Olsson, Olof Gissberg, Osama Saher, Eman M. Zaghloul, Karin E. Lundin, Jesper Wengel, Eric Hanse, Henrik Zetterberg, Dzeneta Vizlin-Hodzic, C. I. Edvard Smith, Rula Zain
Publié dans: Nucleic Acid Therapeutics, 2021, ISSN 2159-3337
Éditeur: Mary Ann Liebert Inc.
DOI: 10.1089/nat.2021.0021

PNA-Based MicroRNA Detection Methodologies

Auteurs: Enrico Cadoni, Alex Manicardi, Annemieke Madder
Publié dans: Molecules, Numéro 25/6, 2020, Page(s) 1296, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules25061296

Beyond small molecules: targeting G-quadruplex structures with oligonucleotides and their analogues

Auteurs: Enrico Cadoni, Lessandro De Paepe, Alex Manicardi, Annemieke Madder
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 49/12, 2021, Page(s) 6638-6659, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab334

Metal‐Mediated Base Pairing of Rigid and Flexible Benzaldoxime Metallacycles

Auteurs: Sajal Maity, Madhuri Hande, Tuomas Lönnberg
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 21/16, 2020, Page(s) 2321-2328, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000135

Transfecting tissue models with CRISPR/Cas9 plasmid DNA using peptide dendrimers

Auteurs: Susanna J. Zamolo, Tamis Darbre, Jean-Louis Reymond
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 56/80, 2020, Page(s) 11981-11984, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0cc04750c

Further Probing of Cu2+-Dependent PNAzymes Acting as Artificial RNA Restriction Enzymes.

Auteurs: Olivia Luige; Merita Murtola; Alice Ghidini; Roger Strömberg
Publié dans: Molecules, 24 (4), Numéro 1, 2019, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3929/ethz-b-000327274

The Mechanism of Cleavage of RNA Phosphodiesters by a Gold Nanoparticle Nanozyme

Auteurs: Joanna Czescik, Fabrizio Mancin, Roger Strömberg, Paolo Scrimin
Publié dans: Chemistry – A European Journal, Numéro 27/31, 2021, Page(s) 8143-8148, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202100299

Teaching photosensitizers a new trick: red light-triggered G-quadruplex alkylation by ligand co-localization

Auteurs: Enrico Cadoni, Alex Manicardi, Mathieu Fossépré, Kaat Heirwegh, Mathieu Surin, Annemieke Madder
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 57/8, 2021, Page(s) 1010-1013, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0cc06030e

Synthesis and Hybridization Properties of Covalently Mercurated and Palladated Oligonucleotides

Auteurs: Dattatraya Ukale, Sajal Maity, Madhuri Hande, Tuomas Lönnberg
Publié dans: Synlett, Numéro 30/15, 2019, Page(s) 1733-1737, ISSN 0936-5214
Éditeur: Georg Thieme Verlag
DOI: 10.1055/s-0037-1611821

Palladacyclic Conjugate Group Promotes Hybridization of Short Oligonucleotides

Auteurs: Madhuri Hande, Sajal Maity, Tuomas Lönnberg
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 19/6, 2018, Page(s) 1588, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms19061588

A Versatile and Convenient Synthesis of 34 S-Labeled Phosphorothioate Oligonucleotides

Auteurs: Rouven Stulz, Johan Meuller, Dženita Baždarević, Charlotte Wennberg Huldt, Roger Strömberg, Shalini Andersson, Anders Dahlén
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 19/19, 2018, Page(s) 2114-2119, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.201800417

Oligonucleotide–Palladacycle Conjugates as Splice-Correcting Agents

Auteurs: Madhuri Hande, Osama Saher, Karin Lundin, C. Smith, Rula Zain, Tuomas Lönnberg
Publié dans: Molecules, Numéro 24/6, 2019, Page(s) 1180, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules24061180

Exploiting Double Exchange Diels-Alder Cycloadditions for Immobilization of Peptide Nucleic Acids on Gold Nanoparticles

Auteurs: Enrico Cadoni, Daniele Rosa-Gastaldo, Alex Manicardi, Fabrizio Mancin, Annemieke Madder
Publié dans: Frontiers in Chemistry, Numéro 8, 2020, ISSN 2296-2646
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fchem.2020.00004

Factors Influencing the Activity of Nanozymes in the Cleavage of an RNA Model Substrate

Auteurs: Czescik, Zamolo, Darbre, Mancin, Scrimin
Publié dans: Molecules, Numéro 24/15, 2019, Page(s) 2814, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules24152814

Multifunctional, CD44v6-Targeted ORMOSIL Nanoparticles Enhance Drugs Toxicity in Cancer Cells

Auteurs: Morillas-Becerril, Peta, Gabrielli, Russo, Lubian, Nodari, Ferlin, Scrimin, Palù, Barzon, Castagliuolo, Mancin, Trevisan
Publié dans: Nanomaterials, Numéro 10/2, 2020, Page(s) 298, ISSN 2079-4991
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/nano10020298

Oligonucleotide Binding to Non-B-DNA in MYC

Auteurs: Tea Umek, Karin Sollander, Helen Bergquist, Jesper Wengel, Karin E. Lundin, C.I. Edvard Smith, Rula Zain
Publié dans: Molecules, Numéro 24/5, 2019, Page(s) 1000, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules24051000

Sugar and Polymer Excipients Enhance Uptake and Splice-Switching Activity of Peptide-Dendrimer/Lipid/Oligonucleotide Formulations

Auteurs: Osama Saher, Taavi Lehto, Olof Gissberg, Dhanu Gupta, Oskar Gustafsson, Samir EL Andaloussi, Tamis Darbre, Karin E. Lundin, C. I. Edvard Smith, Rula Zain
Publié dans: Pharmaceutics, Numéro 11/12, 2019, Page(s) 666, ISSN 1999-4923
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pharmaceutics11120666

Poly(lipoic acid)-Based Nanoparticles as Self-Organized, Biocompatible, and Corona-Free Nanovectors

Auteurs: Jakub W. Trzciński, Lucía Morillas-Becerril, Sara Scarpa, Marco Tannorella, Francesco Muraca, Federico Rastrelli, Chiara Castellani, Marny Fedrigo, Annalisa Angelini, Regina Tavano, Emanuele Papini, Fabrizio Mancin
Publié dans: Biomacromolecules, Numéro 22/2, 2021, Page(s) 467-480, ISSN 1525-7797
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.0c01321

Visible-light triggered templated ligation on surface using furan-modified PNAs

Auteurs: Alex Manicardi, Enrico Cadoni, Annemieke Madder
Publié dans: Chemical Science, Numéro 11/43, 2020, Page(s) 11729-11739, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0sc04875e

New Alkyne and Amine Linkers for Versatile Multiple Conjugation of Oligonucleotides

Auteurs: Dmytro Honcharenko, Kristina Druceikaite, Malgorzata Honcharenko, Martin Bollmark, Ulf Tedebark, Roger Strömberg
Publié dans: ACS Omega, Numéro 6/1, 2021, Page(s) 579-593, ISSN 2470-1343
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsomega.0c05075