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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Reverse Engineering Gene Regulatory Networks

Obiettivo

Gene regulatory networks (GRNs) are an important cellular signal processing mechanism for translating input signals into
appropriate phenotypes by modulating expression of the genome. The quantitative details of how cells process information
through GRNs are still poorly understood, but of central importance in a large number of biological processes. Considerable
progress has been made in mapping the topology of GRNs and more recently in deciphering the relationship between
promoter sequence and function. Nonetheless, it is not yet possible to computationally predict the output of most native
promoters, nor is it trivial to build promoters that integrate signals in a novel and predictive manner. Developing a
quantitative understanding of transcriptional regulation, ultimately leading to the ability to predict entire GRNs will be a
significant achievement and a prerequisite for our ability to engineer biological systems.
I propose a multi-disciplinary approach incorporating biology, engineering, and computational modelling to improve our
quantitative understanding by reverse engineering GRNs in S. cerevisiae. My research group has developed a powerful set
of unique, high-throughput microfluidic technologies that enable the quantitative analysis of GRNs in vitro and in vivo.
Specifically I propose to quantitatively investigate the yeast phosphate regulatory network and to develop a master model
capable of predicting output of the network under various inorganic phosphate concentrations, to develop novel approaches
for modulating GRNs using engineered Zn-finger transcription factors (TF) and CRISPR/Cas, to link GRN output to fitness
in order to develop an understanding of how networks are optimized and evolve, and to reverse engineer an exact
functional copy of the native phosphate regulatory network with orthogonal components.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-COG - Consolidator Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2016-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 993 858,00
Indirizzo
BATIMENT CE 3316 STATION 1
1015 LAUSANNE
Svizzera

Mostra sulla mappa

Regione
Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Vaud
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 993 858,00

Beneficiari (1)

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