Obiettivo
During the translation of genetic information into protein by the ribosome, nascent peptides occasionally inhibit their own synthesis by interacting with the exit tunnel of the large ribosomal subunit. Known as nascent chain-mediated translational arrest, this process depends primarily upon the amino acid sequence of the arrest peptide. However, it can also rely upon the sensing of a low molecular weight ligand by the ribosome nascent chain complex, explaining its use for metabolite-dependent gene regulation in both bacteria and eukaryotes. Biochemical and structural studies of arrest peptides have yielded key insights into their mode of action, but their ability to sense different types of small molecules, their impact as regulators of gene expression in nature and the precise molecular details behind the arrest process are still largely unexplored.
The groundbreaking aim of this ERC Consolidator research program is to decipher the arrest code governing nascent chain-mediated translational arrest in bacteria. My approach will be based on a technique recently developed in my group, referred to here as inverse toeprinting, which precisely maps the position of an arrested ribosome nascent chain complex on the mRNA while retaining the entire peptide-coding region up to the point of stalling.
The overall aim will be achieved through four complementary objectives: (i) to assess the extent to which arrest peptides can act as small molecule sensors; (ii) to identify naturally occurring arrest peptides in bacteria; (iii) to develop trans-inhibitory peptides that target the ribosome; and (iv) to perform the structural characterization of new ribosome inhibitory peptides.
By addressing the natural diversity and molecular bases of the arrest process, this project will be the key to understanding a unique form of gene regulation and a fundamental aspect of ribosome function. It will also provide a handle for designing next-generation antibiotics.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2016-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75654 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.