Objectif
Protein synthesis and degradation, energy metabolism, signalling, processing of information-encoding polymers (RNA and DNA) are facilitated and regulated by molecular machines, protein complexes that undergo significant conformational changes in time as they facilitate their function. To be able to control the biological processes rationally and with high precision it is essential to understand their mechanism at atomic level. A powerful way to gain detailed insight onto function of these proteins is to see these molecules at atomic resolution while they function. The high-resolution structures of biological macromolecules obtained by X-ray crystallography, NMR and more recently single particle electron cryogenic microscopy (cryo-EM) have provided insights onto the way many molecular machines are constructed. These methods generally provide snapshots of discrete long-lived states, visualizing the conformational changes along the reaction trajectory at high-resolution often remains an elusive objective.
The aim of my proposal is to develop methods for visualizing transient conformations of protein complexes by time-resolved single particle cryo-EM. Time-resolved cryo-EM combines structural study with kinetics by freeze-trapping kinetic intermediates in a biological reaction and has potential to provide atomic-resolution ‘movies’ of functioning biological complexes. Technical limitations however so far restricted widespread use and utilization of the complete potential of this technique.
Main part of this project is dedicated to development of microfluidic instruments for cryo-EM sample preparation. If successful, our approaches will allow trapping kinetic intermediates of molecular machines with millisecond time-resolution using picogram amounts of protein sample. The developed method will be applied to resolve key functional conformations of respiratory complex I and observe regulatory trajectories of ligand-gated ion channels.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géologie minéralogie cristallographie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2016-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.