Objectif
Living cells are constantly barraged by perturbations that originate within themselves. Especially abundant – far more than DNA mutations – are two kinds of such perturbations. The first is gene expression noise, pervasive stochastic variation of transcript and protein levels. The second is mistranslation noise, the misincorporation of amino acids by ribosomes during protein synthesis. Organisms and protein molecules can evolve robustness – the persistence of well-adapted phenotypes – to both kinds of noise. Theory predicts that noise and robustness can affect the adaptive evolution of new proteins, but we do not know whether they help or hinder adaptive evolution. We hypothesize that noise and robustness can accelerate protein evolution both separately and jointly. To validate this hypothesis, we will evolve light-emitting fluorescent proteins towards new color phenotypes via directed laboratory evolution in E.coli. During evolution, we will manipulate expression noise by driving FP expression from noisy or quiet promoters, and we will manipulate mistranslation via host strains with low and high mistranslation rates. We will manipulate protein robustness in three biologically important ways, chaperone overexpression, gene duplication, and stabilizing selection. We will study how fast FPs evolve new colors, and analyze protein evolutionary dynamics through a combination of high-throughput sequencing, engineering of selected adaptive mutations, and data-driven modeling. Our project will show how a ubiquitous but poorly understood source of phenotypic variation affects protein innovation. It will also help engineers discover new protein functions. Moreover, our work will help establish FPs as a major platform to study protein evolutionary dynamics. By revealing noise as a new and crucial factor in protein evolution, our observations have the potential to revolutionize molecular evolution research, much like earlier studies of noise have revolutionized cell biology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique amines
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire évolution moléculaire
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2016-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8006 Zurich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.