Objetivo
To date, mechanistic studies on the macromolecular complexes that synthesize or degrade RNAs or proteins have investigated these machines individually to understand how they execute different steps in the gene expression process. Although the individual complexes catalyze their reactions independently of each other in vitro, increasing evidence suggests that they function in a highly coordinated manner in vivo. The molecular basis for such a coordination remains largely unknown. During the past five years, our group has focused on deciphering the mechanisms of multiprotein complexes that mediate mRNA turnover in S. cerevisiae. Here, I propose to take these analyses to the next level and visualize how a major RNA degradation machine, the exosome, is directly coupled to the protein-synthesis machine, the ribosome. In particular, we want to study two different exosome-ribosome assemblies that underpin opposite outcomes of RNA degradation: a constructive function of the nuclear exosome in the maturation of the large ribosomal subunit and a destructive function of the cytoplasmic exosome in the elimination of ribosome-bound mRNAs. Building on our preliminary data from both the yeast and human systems, we will use a combination of bottom-up biochemical reconstitutions and top-down endogenous purifications to isolate 1) an exosome complex and its nuclear cofactors bound to a pre-60S ribosomal subunit and 2) an exosome complex and its cytoplasmic cofactors bound to a stalled 80S ribosome. We will determine the structures of these ~3 - 4 MDa nuclear and cytoplasmic assemblies using the combined information from cryo-electron microscopy and X-ray crystallography approaches. The structural studies, combined with biochemical and genetic information, will reveal how these machines interact and coordinate RNA metabolism with protein synthesis. Overall, this work will provide important insight into the principles that coordinate different steps of eukaryotic gene expression.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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- ciencias naturales ciencias de la tierra y ciencias ambientales conexas geología mineralogía cristalografía
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología celular
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- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2016-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
80539 MUNCHEN
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.