Obiettivo
To date, mechanistic studies on the macromolecular complexes that synthesize or degrade RNAs or proteins have investigated these machines individually to understand how they execute different steps in the gene expression process. Although the individual complexes catalyze their reactions independently of each other in vitro, increasing evidence suggests that they function in a highly coordinated manner in vivo. The molecular basis for such a coordination remains largely unknown. During the past five years, our group has focused on deciphering the mechanisms of multiprotein complexes that mediate mRNA turnover in S. cerevisiae. Here, I propose to take these analyses to the next level and visualize how a major RNA degradation machine, the exosome, is directly coupled to the protein-synthesis machine, the ribosome. In particular, we want to study two different exosome-ribosome assemblies that underpin opposite outcomes of RNA degradation: a constructive function of the nuclear exosome in the maturation of the large ribosomal subunit and a destructive function of the cytoplasmic exosome in the elimination of ribosome-bound mRNAs. Building on our preliminary data from both the yeast and human systems, we will use a combination of bottom-up biochemical reconstitutions and top-down endogenous purifications to isolate 1) an exosome complex and its nuclear cofactors bound to a pre-60S ribosomal subunit and 2) an exosome complex and its cytoplasmic cofactors bound to a stalled 80S ribosome. We will determine the structures of these ~3 - 4 MDa nuclear and cytoplasmic assemblies using the combined information from cryo-electron microscopy and X-ray crystallography approaches. The structural studies, combined with biochemical and genetic information, will reveal how these machines interact and coordinate RNA metabolism with protein synthesis. Overall, this work will provide important insight into the principles that coordinate different steps of eukaryotic gene expression.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze della terra e scienze ambientali connesse geologia mineralogia cristallografia
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
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(si apre in una nuova finestra) ERC-2016-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
80539 MUNCHEN
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.