Dissecting and targeting ubiquitin networks in the course of bacterial infections

Informations projet

Ub-BAC

N° de convention de subvention: 742720

DOI 10.3030/742720

Projet clôturé

Date de signature de la CE 8 Juin 2017

Date de début 1 Juillet 2017

Date de fin 30 Juin 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total € 2 500 000,00

Contribution de l’UE € 2 500 000,00

Coordonné par

JOHANN WOLFGANG GOETHE-UNIVERSITAET FRANKFURT AM MAIN
Germany

Publications

Non-peer reviewed articles (1)

Gasdermin B in the host–pathogen tug-of-war

Auteurs: Maculins, T & Dikic I
Publié dans: Cell Research, Numéro 31, 2021, Page(s) 1043-1044, ISSN 1001-0602
Éditeur: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00544-3

Peer reviewed articles (17)

Biochemical characterization of protease activity of Nsp3 from SARS-CoV-2 and its inhibition by nanobodies.

Auteurs: Lee A. Armstrong; Sven M. Lange; Virginia Dee Cesare; Stephen P. Matthews; Raja Sekhar Nirujogi; Isobel Cole; Anthony G. Hope; Fraser Cunningham; Rachel Toth; Rukmini Mukherjee; Denisa Bojkova; Franz S. Gruber; David W. Gray; Paul G. Wyatt; Jindrich Cinatl; Ivan Dikic; Ivan Dikic; Paul Davies; Yogesh Kulathu
Publié dans: PLoS ONE, Numéro 4, 2021, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0253364

SIK2 orchestrates actin-dependent host response uponSalmonella infection

Auteurs: Marcel Hahn, Adriana Covarrubias-Pinto, Lina Herhaus, Shankha Satpathy, Kevin Klann, Keith B. Boyle, Christian Münch, Krishnaraj Rajalingam, Felix Randow, Chunaram Choudhary, and Ivan Dikic
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 118(19), 2021, ISSN 1091-6490
Éditeur: PNAS
DOI: 10.1073/pnas.2024144118

Insights into catalysis and function of phosphoribosyl-linked serine ubiquitination

Auteurs: Sissy Kalayil, Sagar Bhogaraju, Florian Bonn, Donghyuk Shin, Yaobin Liu, Ninghai Gan, Jérôme Basquin, Paolo Grumati, Zhao-Qing Luo, Ivan Dikic
Publié dans: Nature, Numéro 557/7707, 2018, Page(s) 734-738, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0145-8

Mechanism and medical implications of mammalian autophagy

Auteurs: Ivan Dikic, Zvulun Elazar
Publié dans: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Numéro 19/6, 2018, Page(s) 349-364, ISSN 1471-0072
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-018-0003-4

Curvature induction and membrane remodeling by FAM134B reticulon homology domain assist selective ER-phagy

Auteurs: Ramachandra M. Bhaskara, Paolo Grumati, Javier Garcia-Pardo, Sissy Kalayil, Adriana Covarrubias-Pinto, Wenbo Chen, Mikhail Kudryashev, Ivan Dikic, Gerhard Hummer
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-10345-3

A selective ER ‐phagy exerts procollagen quality control via a Calnexin‐ FAM 134B complex

Auteurs: Alison Forrester, Chiara De Leonibus, Paolo Grumati, Elisa Fasana, Marilina Piemontese, Leopoldo Staiano, Ilaria Fregno, Andrea Raimondi, Alessandro Marazza, Gemma Bruno, Maria Iavazzo, Daniela Intartaglia, Marta Seczynska, Eelco Anken, Ivan Conte, Maria Antonietta De Matteis, Ivan Dikic, Maurizio Molinari, Carmine Settembre
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 38/2, 2018, ISSN 0261-4189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.201899847

ER-phagy and human diseases

Auteurs: Christian A. Hübner, Ivan Dikic
Publié dans: Cell Death & Differentiation, 2019, ISSN 1350-9047
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-019-0444-0

Cellular quality control by the ubiquitin-proteasome system and autophagy

Auteurs: Christian Pohl, Ivan Dikic
Publié dans: Science, Numéro 366/6467, 2019, Page(s) 818-822, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aax3769

CYRI/FAM49B negatively regulates RAC1-driven cytoskeletal remodelling and protects against bacterial infection

Auteurs: Kyoko E. Yuki, Hadir Marei, Evgenij Fiskin, Megan M. Eva, Angelica A. Gopal, Jeremy A. Schwartzentruber, Jacek Majewski, Mathieu Cellier, Judith N. Mandl, Silvia M. Vidal, Danielle Malo, Ivan Dikic
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 4/9, 2019, Page(s) 1516-1531, ISSN 2058-5276
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-019-0484-8

Ubiquitin signaling and autophagy

Auteurs: Paolo Grumati, Ivan Dikic
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 293/15, 2018, Page(s) 5404-5413, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.tm117.000117

Open questions: why should we care about ER-phagy and ER remodelling?

Auteurs: Ivan Dikic
Publié dans: BMC Biology, Numéro 16/1, 2018, ISSN 1741-7007
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-018-0603-7

ER-phagy at a glance

Auteurs: Paolo Grumati, Ivan Dikic, Alexandra Stolz
Publié dans: Journal of Cell Science, Numéro 131/17, 2018, Page(s) jcs217364, ISSN 0021-9533
Éditeur: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.217364

Dimerization quality control via ubiquitylation

Auteurs: Lina Herhaus, Ivan Dikic
Publié dans: Science, Numéro 362/6411, 2018, Page(s) 151-152, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aav1391

Inhibition of bacterial ubiquitin ligases by SidJ–calmodulin catalysed glutamylation

Auteurs: Sagar Bhogaraju, Florian Bonn, Rukmini Mukherjee, Michael Adams, Moritz M. Pfleiderer, Wojciech P. Galej, Vigor Matkovic, Jaime Lopez-Mosqueda, Sissy Kalayil, Donghyuk Shin, Ivan Dikic
Publié dans: Nature, Numéro 572/7769, 2019, Page(s) 382-386, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1440-8

Regulation of Phosphoribosyl-Linked Serine Ubiquitination by Deubiquitinases DupA and DupB

Auteurs: Donghyuk Shin, Rukmini Mukherjee, Yaobin Liu, Alexis Gonzalez, Florian Bonn, Yan Liu, Vladimir V. Rogov, Marcel Heinz, Alexandra Stolz, Gerhard Hummer, Volker Dötsch, Zhao-Qing Luo, Sagar Bhogaraju, Ivan Dikic
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 77/1, 2020, Page(s) 164-179.e6, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.019

Mitochondrial Functions in Infection and Immunity

Auteurs: Varnesh Tiku, Man-Wah Tan, Ivan Dikic
Publié dans: Trends in Cell Biology, Numéro 30/4, 2020, Page(s) 263-275, ISSN 0962-8924
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2020.01.006

Serine-ubiquitination regulates Golgi morphology and the secretory pathway upon Legionella infection

Auteurs: Liu Y, Mukherjee R, Bonn F, Colby T, Matic I, Glogger M, Heilemann M, Dikic I
Publié dans: Cell Death & Differntiation, Numéro 28, 2021, Page(s) 2957-2969, ISSN 1350-9047
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-021-00830-y